ImageJ是一個基於 Java 的影像處理軟件，由美國國立衛生研究院和隸屬於威斯康辛大學的光學與計算儀器實驗室所開發。ImageJ 可以作為線上小程式運作、可下載應用程式運行，也可以在任何具有 Java 5 或更高版本虛擬機的電腦上運行，適用於Microsoft Windows，Mac OS，Mac OS X，Linux，和Sharp Zaurus等平台。
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ImageJ 可以顯示、編輯、分析、處理、儲存和列印 8 位元彩色和灰階、16 位元整數和 32 位元浮點影像，亦可以讀取多種影像檔案格式，包括 TIFF、PNG、GIF、JPEG、BMP、DICOM 和 FITS 以及原始格式。
ImageJ 支援影像堆疊，即共用單一視窗的一系列影像，並由於它是多線程的，進而可以在多 CPU 硬件上並行執行耗時的操作。ImageJ 也可以計算用戶定義的選擇和強度閾值物件的面積和像素值統計。除了基本的圖像操作（例如縮放、旋轉、扭曲、平滑）之外，ImageJ 還可以執行圖像的面積和像素統計、距離和角度計算、創建直方圖和剖面圖以及執行傅立葉變換。
外部連結
- ImageJ官方網站 （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館）
- ImageJ維基文件 （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館）
- Review of ImageJ by Forrest Mims III in The Citizen Scientist, the journal of the Society for Amateur Scientists。
- ImageJ Plugin home （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館）
- ImageJ Plugin Project （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館） @ Sourceforge.net
- Bio-medical Imaging plugins （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館）
- The Image Stabilizer plugin （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館）:圖像序列去抖動
- OptiNav plugin set：Aeroacoustics, real time histograms, deconvolutions.
- Large set of plugins by Gabriel Landini
- Albert Cardona's 3D editing plugins。
- Plugins for surface assessment （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館） from GCSCA
- TrakEM2：a plugin for morphological data mining, image annotation and 3D modeling.
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