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藍色基因（英語：Blue Gene）是一個由IBM主導的電腦系統結構計劃，用來製造一系列的超級電腦，已達到千兆（=1016）每秒的浮點運算的能力。
本計劃製造了三代超級電腦，分別是Blue Gene/L(1999年2月)、Blue Gene/P(2007年6月)和Blue Gene/Q(2011年11月)。
截至2012年6月，世界上運算速度最快的超級電腦——Sequoia（紅杉），即是由IBM為美國勞倫斯‧利弗莫爾國家實驗室研發的Blue Gene/Q，它內含1572864個處理器，每秒能完成16千兆次浮點運算（16PFLOPS）。
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