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肌肉組織（Muscle tissue）是組成動物身體肌肉的軟組織，肌肉的收縮是透過肌肉組織進行的。這和肌肉中其他的組織（例如腱或肌束膜）相反。肌肉組織是在胚胎發育時藉由肌發生（myogenesis）的過程而形成的[1]。
肌肉組織隨着其機能以及在身體內的位置而不同。哺乳類有三種肌肉組織：骨骼肌（skeletal muscle，也稱為條紋肌）、平滑肌（smooth muscle）及心肌（cardiac muscle，有時也稱為半條紋肌）。平滑肌和心肌都可以在沒有意識介入的情形下自發性的收縮。這些肌肉是透過中樞神經系統的互動來所其活動，也會受到周邊神經叢或是內分泌系統的控制。骨骼肌只會在有意識下收縮，是受到中樞神經系統的影響。反射是一種骨骼肌的無意識動作，雖然進行時不會有大腦皮質的介入，但仍然是由中樞神經系統使其動作。[1]
三種肌肉組織對神經遞質及激素（例如乙酰膽鹼、去甲基腎上腺素、腎上腺素及一氧化氮等）的反應是不同的的，依其肌肉形態以及組織在肌肉中的位置而定[1]。
肌肉（肌細胞）是長型的細胞，其長度從數毫米到十厘米不等，寬度則在10至100微米之間[2]。肌肉細胞相互結合，形成組織，肌肉組織是條紋肌或平滑肌則依稱為肌絲的肌原纖維收縮蛋白，是否有規則、週期性的出現在肌肉組織中而定。條紋肌可以再細分為骨骼肌以及心肌[3]。骨骼肌會受意識控制，而平滑肌不會。因此 肌肉組織可以分為以下的三種：
脊椎動物有以下這種肌肉：
心肌及骨骼肌有條紋的原因是其中包括肌小節，而且肌肉結合成高度規則的束狀結構。平滑肌則不然。骨骼肌會呈規則的、平行的肌肉束，心肌會以分支、不規則的角度相連接（稱為肌間盤intercalated disc）。條紋肌會以時間較短、強度較高的方式進行收縮及放鬆，而平滑肌可以維持時間較長，甚至近乎於永久性的收縮。
| 平滑肌 | 心肌 | 骨骼肌 | |
| 解剖學 | |||
| 神經肌肉接點 | 無 | 無 | 有 |
| 肌纖維 | 梭形，短（<0.4 mm） | 分支 | 柱形，長（<15 cm） |
| 線粒體 | 少 | 多 | 有多有少，依種類而定 |
| 細胞核 | 1 | 1 | >1 |
| 肌小節 | 無 | 有，最長2.6 µm | 有，最長3.7 µm |
| 合胞體 | 無（獨立細胞） | 無（但有類似的功能） | 有 |
| 內質網 | 較短 | 中等 | 較長 |
| ATPase | 少 | 中等 | 豐富 |
| 生理學 | |||
| 自調節 | 自發性調節（慢） | 有（快速） | 無（依神經刺激而反應） |
| 對刺激的反應 | 不反應 | 全有全無律 | 全有全無律 |
| 動作電位 | 是 | 是 | 是 |
| 對刺激的反應 | 
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骨骼肌可以再細分為以下的幾類：
平滑肌是不受意識控制的肌肉，沒有條紋平滑肌可以分為兩類：單組織平滑肌及多組織平滑肌。單組織平滑肌中，整束肌肉成為合胞體（多核細胞質團，但不細分為細胞）多組織平滑肌就會細分為細胞，因此可以有精細的控制以及漸進的反應，就像骨骼肌中的運動單元反應一樣。
平滑肌會在淋巴管、膀胱、子宮（稱為子宮平滑肌）、男性及女性的生殖道、消化道、呼吸道、皮膚的立毛肌、眼部的睫狀肌以及虹膜。不同器官中的平滑肌細胞結構及機能基本上是相近的，不過因為配合各器官的不同反應時間進行對應動作，其誘導刺激顯著的不同。另外，腎臟的腎小球也有類似平滑肌的腎小球繫膜細胞。
心肌（Cardiac muscle）是心臟部位不受意識控制的條紋肌組織，出現在心臟壁，也是心臟的基礎組織。組成心臟肌肉的細胞稱為心肌細胞，多半只有一個細胞核，不過也有二個或四個細胞核的情形[8][9]。心肌（myocardium）是心臟中的肌肉組織，是在外圍的心外膜層及內圈的心內膜層之間，較厚的一層組織。
心肌細胞會有協調性的收縮，將心房及心室的血液打到往全身以及肺部的血管中，成為血液循環的一部份。這些精細的機制讓心臟可以定時的收縮。
心肌細胞和身體其他細胞不同，需要有效的血液及電子來源來提供氧氣及養份，並且移除像二氧化碳之類的代謝後產物。冠狀血管就是負責這類機能的血管。
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