1939年9月波蘭戰役期間,總計有15萬至20萬波蘭人喪生[26]。入侵部隊對殺戮對象不加分辨,常常刻意以平民百姓為目標。[27]超過10萬波蘭人死於納粹德國空軍的恐怖性轟炸行動,比如轟炸維隆。[28]德國空軍大規模空襲沒有軍事設施的城鎮。[29]9月13日,盧布林附近的弗蘭波爾遭德國空軍轟炸,用來測試空軍的轟炸技術。德軍選擇該城市做實驗對象,是因為該市棋盤狀的街道佈局,而且城中央的市政廳便於識別。弗蘭波爾遭70噸彈藥轟炸(英語:Bombing of Frampol),[30]該市90%的建築被毀,半數居民遇害。[31]逃跑的難民隊伍被德國的戰鬥機與俯衝轟炸機系統性地攻擊。[32]
作為納粹摧毀波蘭的計劃的一部分,德國對波蘭實施了文化滅絕。德國人劫掠並摧毀了圖書館、博物館、科研機構、實驗室、名勝古蹟和歷史遺產。[130]德國人關閉了所有的大學與高中,系統地屠殺波蘭學者、教師和神父。[80]納粹燒毀了數百萬本書籍,包括80%的學校圖書館,以及75%的科學圖書館。[131]波蘭兒童被禁止接受小學以上的教育,目的是讓波蘭將來不能出現新一代領導人。[80]海因里希·希姆萊1940年5月的一份備忘錄如此寫道:「這種教育體系的唯一目標就是只教他們簡單的算術,不要教超過500的數字;讓他們學會寫自己的名字;還有為他們灌輸教義:『服從德國人』是神聖的法則。我不認為應該教他們閱讀。」[80]1941年,在德國波蘭總督府上小學的兒童只有戰前的一半。[38]為了對抗納粹德國的教育政策,波蘭地下組織發起了「秘密教學(英語:Education in Poland during World War II)」(Tajne Nauczanie)運動。
天主教會在瓦爾特蘭大區受到的壓制比其他地方更為嚴厲。[143]受萊因哈德·海德里希與馬丁·鮑曼的鼓勵,瓦爾特蘭大區長官阿圖爾·格賴澤爾(英語:Arthur Greiser)猛烈打擊了天主教會。教會財產和資金被沒收,平信徒組織被關閉。理查德·埃文斯(英語:Richard J. Evans)寫道,「許多神職人員、僧侶、教區行政人員和教會官員被逮捕,被驅逐到總督府,或是被帶到帝國的集中營,或者乾脆被槍斃。共有約1700名波蘭神父被關在達豪;其中一半沒能活下來。」格賴澤爾的行政主管奧古斯特·雅格(英語:August Jager)先前曾領導過普魯士福音派教會的納粹化工作。[144]由於對教會的強烈敵意,他在波蘭獲得了「教會獵手」(Kirchen-Jager)的綽號。[145]
據埃文斯的說法,「到了1941年底,瓦爾特蘭的波蘭天主教會實際上已被取締。儘管教宗早在1939年10月27日就發佈通諭,抗議對教會的迫害,但在其他被佔領領土上,教會或多或少都被日耳曼化了。」[143][146]波美拉尼亞的650名神父中,有630人被殺害或被送往集中營。1939年至1945年間,波蘭神職人員中有2935人在集中營遇害,[147]占人員總數的18%.[148]弗沃茨瓦韋克有49%的天主教神父被殺害;海烏姆諾也有48%的神父遇害。1999年,教廷將108名遇難的波蘭天主教徒(英語:108 Martyrs of World War II)認定為殉道真福。馬希連·國柏神父在奧斯威辛自願替一位陌生人赴死,於1982年被封為聖人。
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