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基因座(英語:locus,gene locus;複數:loci)又稱基因位點、位點,是一生物學與遺傳算法術語,指某個基因或具有調控作用的遺傳標記在染色體上所處的特定位置。[1]一個基因座可用染色體編號、染色體長短臂代號和其在染色體上所處的「區」、「帶」、「子帶」編號位置表示。
基因座上的DNA序列可能有許多不同的變化,各種變化形式稱為等位基因(allele)。基因座在基因組中的排列位置稱為基因圖譜(genetic map),基因作圖(gene mapping)則是測定基因座與特定性狀關係的過程。
二倍體與多倍體細胞的某些染色體上,在同一基因座上有相同的等位基因,這類細胞稱為純合子/同型合子(homozygous)。若是相同基因座上含有不同的等位基因,則稱作雜合子/異型合子(heterozygous)。
舉例而言,一個典型的基因座可能寫成「6p21.3」,解釋如下
區、帶和子帶是從着絲粒向外朝端粒開始編號。基因座詳細命名規則如下:
一個範圍之內的基因座的寫法類似,例如OCA1基因的基因座可寫成「11q1.4-q2.1」,表示此基因位於11號染色體q臂中的1號帶4號子帶,到2號帶1號子帶之間。
染色體的末端寫成「pter」或「qter」,例如「2qter」表示2號染色體的端粒。