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山東大學齊魯醫學院前身山東醫科大學是中國最早的醫學院校之一，1952年由創辦於1911年的齊魯大學所屬的醫學院、山東省立醫學院、華東白求恩醫學院合併成立。1985年山東醫學院更名為山東醫科大學。2000年，山東大學、山東醫科大學、山東工業大學合併組建為新的山東大學後，山東醫科大學校被分拆為5個獨立的醫學專業學院：醫學院、公共衛生學院、口腔醫學院、藥學院和護理學院。原山東醫科大學校址所在地（濟南市文化西路44號）更名為山東大學西校區，2009年4月29日再次更名為山東大學趵突泉校區。
2012年5月，山東大學整合醫學院、公共衛生學院、口腔醫學院、藥學院、護理學院等5個學院以及山東大學齊魯醫院、山東大學第二醫院、山東大學口腔醫院、山東大學附屬生殖醫院等4所附屬醫院，成立齊魯醫學部，首任部長為中國工程院院士、時任山東大學醫學院院長、山東大學齊魯醫院心內科主任張運教授。
2015年9月，山東大學為落實教育部等六部門《關於醫教協同深化臨床醫學人才培養改革的意見》，依據《山東大學章程》及《山東大學綜合改革方案》，頒佈了《醫學教育管理體制改革實施方案》，重構齊魯醫學部管理架構，成立齊魯醫學部黨工委。齊魯醫學部下設辦公室（與黨工委辦公室合署辦公）、政工處、人事處、教務處、科研與國際交流處、研究生處、財務與資產管理處、繼續（網絡）教育中心和醫院管理處等黨政管理機構。同時撤銷醫學院建制，組建基礎醫學院和臨床醫學院。2017年9月18日，正式更名為山東大學齊魯醫學院。[3]
齊魯大學醫學院創建於1903年，是中國最早創辦的西醫院校之一；華東白求恩醫學院是1944年由新四軍創辦的一所軍事院校；山東省立醫學院創建於1932年，1948年併入華東白求恩醫學院，1950年改名為山東醫學院。1952年齊魯大學醫學院併入山東醫學院，仍稱山東醫學院，校址遷至原齊魯大學校園。1985年更名為山東醫科大學。1997年為衛生部和山東省政府共建。[4]
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