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上海市公共衛生臨床中心（英語：Shanghai Public Health Clinical Center），又名復旦大學附屬公共衛生臨床中心、復旦大學附屬中山醫院南院，位於上海市金山區漕廊公路2901號，是上海申康醫院發展中心下屬國營三級甲等專科醫院，充當了醫療、教學、科研、預防的角色。其始建於1914年，在2004年本部搬遷到金山區[1]。目前核定床位660張。在虹口區設有分部。[2]
該醫院歷史可追溯至1914年上海公共租界工部局設立的華人隔離醫院，1945年更名上海市立第一傳染病醫院，1955年再次更名為上海市傳染病醫院。2004年，在保留原有的市區門診部的同時，為加強應對突發公共衛生事件能力，上海市傳染病醫院主院區外遷金山區，更名上海市公共衛生臨床中心。[3]
該中心有73個內設機構，有用於醫療的呼吸內科、感染科、兒科、中醫科、結核科、綜合內科、口腔科、眼科、超級細菌治療科[4]、新冠科[5]等，也有用於辦公的後勤保障部（總務）、後勤保障部（保衛）、物資管理部、人力資源部、績效管理辦公室等，還有用於科研的科學研究部、病原體檢測和生物安全部、實驗動物部、轉化醫學部等。[2][6]
中心的主要功能為預防和治療各類法定傳染病，如愛滋病、肺結核、病毒性肝炎、乙型腦炎等。[6]
以下為歷年開支數目，單位均為萬元。
| 財政撥款支出預算（公共預算撥款支出預算） | 政府性基金撥款支出預算 | 其他 | 總和 | ||
|---|---|---|---|---|---|
| 社會保障和就業支出 | 衛生健康支出 | 住房保障支出 | |||
| 3,516 | 31,715 | 1,000 | 0 | 96567 | 132,798 |
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