蝙蝠冠狀病毒Rp3(Bat SARS-CoV/Rp3/2004)是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒(SARSr-CoV)的一個病毒株,為SARS-CoV相關病毒,在中國廣西的皮氏菊頭蝠樣本中發現,於2005年發表。
Quick Facts Rp3病毒, 病毒分類 ...
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2004年3月至11月,研究人員在中國廣東、天津、廣西與湖北四省市採集蝙蝠樣本,在廣西南寧皮氏菊頭蝠的糞便樣本中發現SARS相關病毒,即Rp3病毒,於2005年和Rf1病毒與Rm1病毒一起發表[1]。
Rp3病毒的基因組長29736nt[2],序列與SARS-CoV的相似度為92.6%[3],其ORF8和人類以外的大多數SARSr-CoV一樣有一段長29nt的插入序列,為一完整的開放閱讀框,人類的ORF8則因缺少此序列而被分成8a與8b兩個較小的開放閱讀框。Rp3的ORF8(121個胺基酸)比人類SARS病毒ORF8輔助蛋白(121個胺基酸)少一個胺基酸,且兩者胺基酸序列相似度僅35%[1]。另外Rp3與許多蝙蝠SARSr-CoV一樣在刺突蛋白的受體結合結構域(receptor binding domain, RBD)有兩段分別長5和12個胺基酸的序列缺失(但不見於WIV1病毒與SHC014病毒)[4]。
截至2021年1月 (2021-01)[update],SARS-CoV與相關病毒株的系統發生樹:
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. PMID 24172901. doi:10.1038/nature12711 (英語).