CDNA文庫

cDNA文庫篩選在基因功能研究中的應用較早，然而早期的cDNA文庫均為「混合型」（pooled），篩選後的回收鑑定工作非常繁雜。近年來由於人類及其它一些物種的全基因組測序工作的完成，使構建基因組範圍「cDNA陣列文庫」的可能性大為提高。

實例

近來諾華（Novartis）基因組學研究所構建了一個包括20704個全長人體cDNA克隆陣列文庫，所有的基因均以「pCMVsport6」作為表達載體，可在哺乳類細胞內表達。

過程

應用該文庫，他們首先進行了一個基因組範圍的篩選以鑑定新的調節活化蛋白-1(AP-1)信號通道的基因產物。 在該實驗中cDNA陣列文庫被分別置於384孔板中，並與含AP-1反應片段的報告基因共同通過轉染導入受檢細胞。轉染後，將細胞在攝氏37度繼續培養48小時，然後加入細胞溶解試劑和化學發光試劑，並以化學發光儀測量光學信號。其信號強弱與AP-1信號通道化的活化程度成正比。本實驗除檢測到多個已知的AP-1信號通道調節因子外，還發現了40多個候選的調節基因，其中一些被進一步證實。隨後，他們通過非常類似的實驗方法對該文庫進行了另一次高通量篩選以尋找調節p53腫瘤抑制子信號通道活性的產物。在該實驗中，他們首先建立了一株能穩定表達「p53-反應區段」（responsive element）控制的報告基因的腫病細胞株（HCT116），然後在384孔板中對該細胞株進行cDNA文庫轉染，並以報告基因來檢測p53活化強度。

結果

該實驗共發現了39個新的可調節p53活性的基因，其中7個對p53活性有正向調節作用、2個為負性調節子。