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腸道菌群
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腸道菌群[1][2](gut flora)或腸道菌相[3],又稱腸道菌群系[4][5](gut microbiome)、腸道菌區系[6](gut microbiota),是定居於腸道中的細菌或真菌等正常菌群[7](normal flora)及其所生活的環境。腸道菌群通過影響食物消化吸收、調控機體免疫和維護腸黏膜屏障,參與維持人體功能和腸道內環境的穩定。
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腸道菌群包括人類及人類以外動物(含昆蟲)的消化道內生存的微生物複雜群落[8]。腸道宏基因組(metagenome)是腸道微生物群(英語:Microbiota)的所有基因組的聚集體[9]。在人體內,腸道是人類微生物群系中的一個利基生態位[10][11]。
與一般商業上應用單一物種的益生菌相比,人類腸道微生物的生物多樣性一旦降低,會影響其宿主的消化功能[8]。所以現時有研究利用多種益生菌的活生物製劑去模擬腸道菌群的多樣性[8],以加強益生菌對人體的功效。人體內的細菌種類多達3萬種[12]、數量約100兆[13]至1000兆[12]。