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南開大學醫學院於1988年籌辦,1993年經原國家教委批准正式成立,現位於南開大學歷史最久遠的建築思源堂內。2017年10月,南開大學與天津市第一中心醫院、天津市第三中心醫院、天津市第四中心醫院、天津市眼科醫院、天津市口腔醫院、天津市人民醫院、天津市胸科醫院、天津市環湖醫院、天津市南開醫院、天津市第二人民醫院、天津市中心婦產科醫院、中國人民解放軍第二五四醫院等12家三級甲等醫院簽署戰略合作協議,各大醫院將承擔南開大學醫學院的臨床教學任務[1]。
1923年10月,南開大學醫學院所在的思源堂作為南開大學科學館竣工,命名「思源堂」,取「飲水思源」之意[2]。該建築建築面積3952平方米,當時為南開大學理工系科使用。1937年7月「七七事變」後,日軍飛機轟炸南開校園,思源堂中彈起火。1945年後,思源堂作為南開大學僅存的老建築得以修復。中華人民共和國成立後,思源堂由南開大學化學學科作為教學樓使用,南開大學醫學院成立後遷入思源堂。[3]
南開大學醫學院下設臨床醫學系和口腔醫學系,同時設立有解剖與組織胚胎學、生理學、生物化學、免疫學、病原生物學、醫學分子遺傳學、藥理學、病理與病理生理學、預防醫學、醫學心理學、臨床技能實訓、醫學高分子材料學、口腔基礎等13個教研室,以及基礎醫學實驗教學中心和5個基礎醫學綜合教學實驗室。
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