內環結構(Internal loop)是一種RNA的高級結構,是RNA雙鏈中兩條鏈上對位的核苷酸殘基的鹼基無法配對產生的膨起環。內環分爲對稱和不對稱兩種。其中,對稱的內環是兩條鏈上對位的核苷酸殘基同時膨起產生的,而不對稱的內環結構中,只有一條鏈上有幾個核苷酸殘基膨起。對稱內環結構不是很穩定,一般只出現在RNA分子的移動過程中。而不對稱內環相對穩定。在核糖體RNA(rRNA)中就有較豐富的內環結構[1][2]。
![](http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/7/7c/Right_angle-2-secondary-structure.svg/150px-Right_angle-2-secondary-structure.svg.png)
內環結構和莖環結構(髮卡結構)的區別在於,內環結構出現在RNA雙鏈的內部,「環」兩端都是閉合雙鏈。而莖環結構的「環」出現在雙鏈的一端[2][1]。
內環可分為對稱或不對稱,其中一些不對稱的內環也稱為凸起(bulge)。 許多重要的結構圖案均由內環組成,例如 C-環[3]、 對接彎頭(the docking-elbow)[4]、 扭結轉彎(k 轉彎)(kink-turns, k-turn)[5][6]、 直角[7]、 sarcin/ricin 環(也稱為為凸起-G, bulged-G 基序)[8][9][10]、 扭曲基序[11]、 和UAA/GAN 內環基序[12]。
參見
參考
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