興南客運玉井站是臺南市政府規劃的大台南公車轉運站，位於台南市玉井區中正路54號，經臺南市政府補助興南客運進行改善工程，於2014年2月22日重新啟用，在旁亦有統一超商進駐服務。本站為行駛台南山區地帶的綠支線與幹線的轉運中樞，同時亦為橘、綠兩大幹線轉運中心。