1990年巴仁鄉暴亂，又稱阿克陶縣巴仁鄉反革命武裝暴亂、巴仁鄉「4·5」武裝暴亂案、巴仁鄉事件、巴仁鄉起義，是1990年4月5日至6日發生在新疆克孜勒蘇柯爾克孜自治州阿克陶縣巴仁鄉的分離主義武裝衝突，中國政府部門、媒體與部分人指此為「暴亂」，部分海外維吾爾人與國外政要稱之為「起義」與「屠殺」。事件中數百名分離主義武裝分子圍攻巴仁鄉政府，並與武警激烈交火。事件導致武警、民兵共8人死亡，21名武裝分子被擊斃。部分人認為，巴仁鄉事件的規模和影響都比1980年代的分離主義活動大得多，是新疆改革開放後大規模分離主義活動的開端。