codon usage bias

是中性的，但認為這些基因的頻率主要受其他與之有連鎖不平衡的基因上的天擇影響，而不是遺傳漂變。此假說也認為微弱的天擇足以解釋密碼子偏差（Codon usage bias） 。 中性假說強調突變、淨化選擇（purifying selection）和遺傳漂變。木村資生建立的中性理論稱大多數的突變是有害的，

基因組不仅仅是是生物基因的集合，对其研究和比较能获得生物演化信息的更多细节。一些基因组性质如“染色体数”（核型）、基因組大小、基因顺序、密码子偏好性（英语：codon usage bias）与GC含量能反映出现存生物的许多基因組演化信息。 基因复制在基因组形成过程中起重要作用。真核生物的基因组存在大量重复序列。按照不同重