ubique）也屬於此綱，α-變形菌的微生物可能佔了海洋微生物的10%左右。 關於本綱所屬的目，有人反對現行的分類法，尤其是Pelagibacterales（英语：Pelagibacterales）的地位，但大體上大家還是普遍接受。細菌的分類學一直是分類學家相當頭痛的問題，因為細菌的基因會彼此互相交流，且基因

（之内）的原核生物。這種理論認爲粒線體起源於好氧細菌（很可能是接近於立克次體的變形菌門細菌，特別是远洋杆菌目（英语：Pelagibacterales）（Pelagibacterales）），而葉綠體源於内共生的光合自營原核生物的藍細菌。這個理論的證據非常完整，目前已經被廣泛接受。