Molecular clock

分子钟（英語：Molecular clock），也叫基因鐘、演化鐘，是一个比喻性术语。是一种根据生物大分子的突变率推断两个或多个生物在演化历史上分离的时间的技术。计算时间所采用的生物大分子往往是DNA的碱基序列或蛋白质的氨基酸序列，同时采用化石和考古数据作为标定。

phylogeny based on eight molecular loci and morphology. Nature. 2001, 413: 157–161.  Gaunt, M.W.; Miles, M.A. An Insect Molecular Clock Dates the Origin of

Ranst, Marc. Complete Genomic Sequence of Human Coronavirus OC43: Molecular Clock Analysis Suggests a Relatively Recent Zoonotic Coronavirus Transmission

的概率，均等于μ。当中性突变的比例为常数时，族群之间的差异率也为常数。尽管分子时钟的发现早于中性演化理论的提出，但这为分子时钟（英语：molecular clock）提供了理论依据。 中性理论与新达尔文主义理论不同，许多分子生物学家和群体遗传学家都为其发展做出了贡献。

Richard, O'Rourke, Dennis , 编, Explaining the Imperfection of the Molecular Clock of Hominid Mitochondria, PLOS ONE, 2009, 4 (12): e8260, Bibcode:2009PLoSO