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型齒翼龍科只包含這兩個屬。在翼龍目內，雙齒型翼龍科的演化位置略比沛溫翼龍衍化；在Macronychoptera演化支內部，雙型齒翼龍科是Caelidracones的姊妹演化支。 根據亞歷山大·克爾納（Alexander Kellner）的研究，雙型齒翼龍、蓓天翼龍並非近親。如果這理論屬實，雙型齒翼龍科將成為無效的分類單元。
Pterodactyliformes †长城翼龙属 Changchengopterus †鬥戰翼龍屬 Douzhanopterus †天龙类 Caelidracones †蛙嘴龙科 Anurognathidae †翼手龙亚目 Pterodactyloidea Lü, J., Unwin, D.M., Jin
長城翼龍屬? 斗战翼龙属 剑尾翼龙属 天 龍 類（英语：Caelidracones）
演化支： †单窗孔类 Monofenestrata 演化支： †翼手龙型类 Pterodactyliformes 演化支： †天龙类 Caelidracones 亚目： †翼手龍亞目 Pterodactyloidea 属： †宁城翼龙属 Ningchengopterus 吕君昌, 2009 種 劉氏寧城翼龍
長城翼龍屬? 斗战翼龙属 剑尾翼龙属 天 龍 類（英语：Caelidracones）