根據記載，早在1243年，這裡已經有一座木製的聖母聖天教堂，由Swiętopełk二世王子興建。^[2]

1343年3月25日聖母領報瞻禮，教堂舉行奠基典禮^[2]。最初教堂的地基以六片區帶一低矮角樓的巴西利卡所占據，1343年至1360年間被清除。部分梁柱和角樓的底層被保留下來。

1379年，石工名匠Heinrich Ungeradin帶領隊伍開始興建今日教堂的工程。到1447年完成了教堂的東部，1452-1466年間塔樓又增修了兩層。

自1485年起這項工程由Hans Brandt主持，他監督建造了中殿核心部分的主體結構。這一工程最終於1496年在Heinrich Haetzl的主持之下完成，他監造了拱形結構的構建。

直到20世紀，教堂的內外都得到了很好的保護，但是在二戰中1945年3月蘇聯紅軍猛攻但澤時嚴重受損。木製屋頂和窗戶被徹底燒毀，大部分天花板和14個大拱頂坍塌，一些磚塊融化，特別是在鐘樓的上部^[2]。

很幸運，內部的大部分藝術品得以倖存，因為它們已經為躲避空襲撤離到附近的村莊。其中許多回到了教堂，也有一些在波蘭各地的博物館展出，教堂正在努力收回它們。

戰後的1946年，開始重建工程。1947年8月屋頂重建。基礎工程完成後，1955年11月17日，教堂再次祝聖。內部的重建工作一直持續至今。

1965年11月20日，教宗保祿六世將這座教堂升格為宗座聖殿。2月2日，主教會議發布公告，宣布這座教堂為天主教格但斯克總教區的共主教座堂（co-cathedral），總教區的總主教座堂是格但斯克的奧利瓦主教座堂。^[2]

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