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原生物種(英語:indigenous species)又稱本土物種(native species),在生物學中指其在該地的分布純粹是自然演化造成的,沒有人為引入的因素夾雜其中。每種野生生物都有一定的自然分布範圍,在該範圍內,該生物被視為是原生物種。物種有可能因人類活動而散布到原生範圍之外,在這些區域該物種就會被視為外來物種。
原生物種不一定是特有種,在生物學及生態學中,特有種是指分布僅侷限於某一地區的某物種,而原生物種則可能在分布於某區域的同時,亦分布於另一區域。原生物種及特有種的觀念都不表示該物種一定起源或演化自該區域[1]。
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