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木棉科(學名:Bombacaceae)是個過時的分類,曾長期被用來歸類木棉屬等多個喬木類群,但由於存在並系群問題,因此自1998年起就被被子植物APG分類法(APG I)歸類為錦葵科(Malvaceae)的一部分,其下原有的成員被分別歸類到木棉亞科、山芝麻亞科之中。
在與錦葵科合併前,約有20-30屬歸類於此,180-250餘種,廣泛分布於全球熱帶地區,以美洲種類最多,中國有5屬,6種,分布在雲南、廣東和廣西各地。
木棉科植物皆為落葉喬木,樹幹粗壯,最高如爪哇木棉(Ceiba pentandra)可高達70米 ;葉互生,單葉或為指狀複葉;花兩性,大型,輻射對稱,單生或聚生;花萼杯狀,花瓣伸長,覆瓦狀排列;果實為蒴果,種子有綿毛。
許多品種的木材有經濟價值,有的可以提取纖維,如木棉(Kapok);南美輕木(Ochroma lagopus)是世界上最輕的木材;榴蓮(Durian),馬來亞的著名水果;猴麵包樹(Bao-bab),在非洲和澳洲乾旱地區的品種,樹幹中貯藏大量水分。1981年的克朗奎斯特分類法將本科放到錦葵目中,1998年根據基因親緣關係分類的APG 分類法和2003年經過修訂的APG II 分類法將本科合併到錦葵科中,列為木棉亞科。
在與錦葵科合併前,本科包含的屬有:
原榴槤屬植物自Heywood et al. 2007後分類於錦葵科山芝麻亞科榴槤族之下
自Heywood et al. 2007後分類於錦葵科之下的屬
自Kubitzki 2003之後認為是異名的屬
Kubitzki未包含之屬
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