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研究生物之间的亲缘关系和演化规律的学科 来自维基百科,自由的百科全书
系統發生學(英語:phylogenetics)又稱種系發生學、譜系發生學、親緣關係學,簡稱譜系學或發生學,是研究及推理生物個體或群體(例如物種或種群)間演化史及關係的科學方法,屬於系統分類學[註 1]的一部分。
上級分類 | 系統分類學、演化生物學 ![]() |
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研究對象 | 種系發生、演化 ![]() |
特性 | 系統發生命名法 ![]() |
從業者 | phylogeneticist ![]() |
Stack Exchange標籤 | https://stackoverflow.com/tags/phylogeny ![]() |
![]() | 此條目需要精通或熟悉相關主題的編者參與及協助編輯。 (2014年4月4日) |
系統發生學的推理方法,通常在性狀演變的特定模型下,評估可觀察到的遺傳性狀(例如DNA序列或生物形態)來「假定」這些生物間的關係。這種分析推理方法的結果,就是系統發生(phylogeny)[註 2],也稱為系統發生樹(phylogenetic tree)——可顯示一群生物演化史的關係圖解假說[3]。系統發生樹的尖端可以是生物體或化石,且代表演化譜系中的現今生物或「末端」生物。
利用系統發生學來分析種系的基本原則是:兩個演化支具有「相同的性狀狀態」是它們對於「共有祖先同一狀態」的保留;而現存生物的性狀就是演化史的紀錄,可作為重建演化史的依據。由系統發生分析的原則,建構了支序分類學的基本邏輯;而系統發生分析已成為理解生物多樣性、演化、生態學和基因組的核心。
系統發生學這個概念不單止用於生物種系的發生與發展,還會用在系統分類學各個層面的分類單元上面。它也會被用到某一性狀在種系發生過程中的演化這一方面。
系統發生學的研究通過以下的手段實現:
通過這些數據,人們就可以為生物建立一棵系統發生樹(演化樹),其中描述了各個物種之間可能有的親緣關係。
系統發生學研究的最大困難是,系統發生學的進化過程是不能被直接通過觀察和實驗被證實的。所以各個方面的證據都要被綜合起來分析。由於對這些證據的側重不同,會經常造成有多個不同的演化樹版本,例如原口類動物的幾個門究竟是歸到蛻皮動物(來自遺傳學方面的證據)還是觸手動物(形態學方面的證據)。
性狀(特徵)分為同源和同功兩種。
同源特徵證實了物種間的親緣關係,是重構進化樹的有力手段。同源現象在生物學中可以進一步分為直系同源(直系同源是指在不同物種中的某一基因來自同一祖先)和旁系同源(種系間的基因複製) 。
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