古蟲界(學名:Excavata)是單細胞生物的一個主要超級群組,屬於真核生物域[2][3][4],由湯瑪斯·卡弗利爾-史密斯於2002年引入的一個新的支序親緣學分類。古蟲界包含了許多自由生存或共生的原生生物,以及一些重要的人體寄生蟲。古蟲界過往被包括進現時被視為已棄用的生物分類「原生生物界」(Protista)[5],一種基於鞭毛構造的分類[6],被認為是 鞭毛蟲的最 lineage[7]。 命名為「古蟲」,是因為在真核生物的系統發生樹處於底部位置,與古菌等外群關係較近,線粒體可能缺失或功能原始。
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特性
許多古蟲界的物種缺乏典型的線粒體,被稱作「無線粒體原生生物」(amitochondriate),雖然大多數可能包含了功能上類似於線粒體、形態有很大變化的細胞器。其它的古蟲界的生物有線粒體,線粒體嵴呈管狀、盤狀、薄片狀。大多數古蟲界物種有兩個、四個甚至更多的鞭毛[6],很多物種有顯著的腹部攝食溝(feeding groove)超微結構,內部由微管支撐[5]。如果有系統發生的基因證據,其它缺乏這一特徵的物種也可以歸屬於古蟲界。
分類
古蟲界在門/綱的級別上分為六類。
總門 | 門/綱 | 有代表性的屬 | 描述 |
---|---|---|---|
盤嵴亞界 Discoba或JEH | 眼蟲門 Euglenozoa | 眼蟲(Euglena)、錐蟲(Trypanosoma) | 很多是重要的寄生蟲,很多含有色素體(葉綠體) |
透色門 Percolozoa或滲養門 Heterolobosea | 耐格里原蟲(Naegleria)、集胞黏菌(Acrasis) | 大多數的形態在鞭毛蟲與似變形蟲之間 | |
雅各巴蟲綱 Jakobea | 雅各巴蟲(Jakoba)、異養鞭毛蟲(Reclinomonas) | 自由生活,有的具鞭毛,有基因豐富的線粒體 | |
後滴門 Metamonada或POD | 前軸柱綱 Preaxostyla | 銳滴蟲 (Oxymonads)、三鞭毛蟲(Trimastix) | 無線粒體,有鞭毛,或者自由生活(三鞭毛蟲)或者寄生於昆蟲的後腸(hindgut) |
多鞭毛蟲綱 Trichozoa或Fornicata | 賈第蟲(Giardia)、Carpediemonas | 無線粒體,大多數共生或寄生在動物體內。 | |
副基體綱 Parabasalia | 毛滴蟲屬(Trichomonas) | 無線粒體有鞭毛,一般共生在昆蟲腸內。某些是人體寄生蟲。 |
眼蟲門(Euglenozoa)與透色門(Percolozoa, Heterolobosea)是特別接近的親緣關係,都具有盤狀的線粒體嵴,因此被歸納為盤嵴總門(Discicristata)。2007年,一項研究表明盤嵴總門與Jakobida目具有基因親緣關係[8] Jakobida目具有類似於其它原生生物的管狀線粒體嵴,因此與盤嵴總門合稱為Discoba亞界或三者首字母縮寫——JEH總界。[3]
後滴門(Metamonad)不尋常地缺少了典型的線粒體——代替線粒體,這些生物具有氫化酶體(hydrogenosome),紡錘剩體(mitosome)或其它未識別的細胞器。共同特點是都沒有線粒體。基因分析表明,這些生物的細胞核中有線粒體的基因標誌。這些生物都是寄生生活的,能夠從其它來源獲得ATP。源真核生物的一個例子是毛滴蟲(Trichomonas Vaginalis),是常見的尿路感染,通過性接觸傳播。
古蟲界是否為單系群(monophyletic group),仍然缺乏基因證據。可能是幾個並行的進化分支。[9]
某些古蟲界的物種被認為是非常原始的真核生物,位於進化樹的底部。這示意古蟲界可能是多系群,包含着其它原生生物的祖先。但這也可能是由於長枝吸引(long branch attraction),這已經在微孢子蟲(microsporidia)中有過前例。
除上述類群外馬拉維單胞蟲綱(Malawimonas)由於其分子系統學證據被認為可能是古蟲中的一種,但其在其中的系統位置待定。[10]
參考文獻
參見
外部連結
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