新鳥小綱

新鳥小綱（學名：Neoaves，又名：新鳥類）這個鳥類演化支包括現生鳥類絕大部分鳥種，除了古顎下綱（平胸鳥類，如鴯鶓、鴕鳥）和雞雁小綱（雁形目、雞形目之類）^[2]，現存大約1萬種鳥種中，有將近95%屬新鳥小綱^[3]。

新鳥類 化石時期：白堊紀晚期 – 現今, 69–0 Ma PreЄ Є O S D C P T J K Pg N [1]
歐洲椋鳥（Sturnus vulgaris）
科學分類
界：	動物界 Animalia
門：	脊索動物門 Chordata
綱：	鳥綱 Aves
演化支：	今顎類 Neognathae
演化支：	新鳥類 Neoaves Sibley（英語：David Allen Sibley） et al., 1988
演化支
夜鳥類 Strisores 鴿鴇類 Columbaves 鶴形目 Gruiformes 水濱鳥類 Aequorlitornithes 望外鳥類 Inopinaves

新鳥小綱各群開始分化出現得十分快速，大約在白堊紀﹣古近紀滅絕事件左右^[4][5]，因此試圖解開他們各群之間的關係，往往會出現許多爭議^[6][7]。

譜系學

由於新鳥小綱各群在白堊紀-古近紀滅絕事件期間分化的太過快速^[5]，導致試圖解決他們之間的親緣關係問題異常複雜，尤其在早期的研究中，甚至出現矛盾的研究成果^[6][7][8]。無論如何，近期對新鳥小綱的一些大規模譜系基因學（英語：phylogenomic）研究，已經對新鳥小綱下的目和總目的定義導引出許多進展，雖然這些研究並未對高階的鳥群分類位階取得共識^{[8][9][10][11]}。埃里希·賈維斯等人在2014年針對48分類群所做的基因學研究，把新鳥小綱分成兩個主演化支：鴿鴇類和雀類，而理查德·普魯姆等人在2015年分析198個分類群，則恢復許多新鳥小綱裡、早期分化出的許多分類群^[9][10]。2017年，雷迪等人使用延伸的資料組重新分析，認為這只不過是排序資料型態的差異，編碼序列對普魯姆等人的分類位階有利^[11]。對這種分類位階持反對意見者，像瑞典烏普薩拉大學的亞歷山大·蘇，在2016年就透過更大型的譜系基因學研究，甚至提出有9個演化支的實多分支（英語：hard polytomy），直接就隸屬在新鳥小綱之下^[12]。到了2019年，美國古生物學家彼得·厚德等人的分析結果，重新採用鴿鴇類，以及搭配6個實多分支的雀類^[13]。

總合來說，這些研究都同意有許多總目，雷迪在2017年取了一個特殊的名稱叫「大哉七」，搭配3個獨立目，構成新鳥小綱^[11]。有意思的是，他們都包含一大群鳥種的陸鳥演化支──陸鳥類，以及一大群鳥種的水鳥演化支──水濱鳥類。下面是雷迪定義的鳥類分類群：

• 大哉七總目演化支：

1. 陸鳥類 Telluraves
2. 水濱鳥類 Aequornithes
3. 日鳽總目 Eurypygimorphae（日鳽、鷺鶴和熱帶鳥）
4. 鴇形總目 Otidimorphae（蕉鵑、鴇和杜鵑）
5. 夜鳥類 Strisores（夜鷹、雨燕和蜂鳥）
6. 鴿形總目 Columbimorphae（擬鶉、沙雞和鳩鴿）
7. 奇蹟鳥類 Mirandornithes（火鶴和鸊鷉）

• 3個獨立目：
  • 麝雉目 Opisthocomiformes（麝雉科）
  • 鶴形目 Gruiformes（鶴科和秧雞科）
  • 鴴形目 Charadriiformes（涉禽, 鷗、海雀科）

Jarvis et al. (2014)[2]

鳩鴿類 Columbea   奇蹟鳥類 Mirandornithes（紅鶴、鸊鷉）     鴿形總目 Columbimorphae (鳩鴿、擬鶉、沙雞)     雀類 Passerea   Otidae（英語：Otidae）   鴇形總目 Otidimorphae（杜鵑、鴇、蕉鵑）     夜鳥類 Strisores（蜂鳥、雨燕、夜鷹）           Gruae（英語：Gruae）   麝雉目 Opisthocomiformes（麝雉）   鶴形總目 Gruimorphae   鶴形目　Gruiformes（鶴、秧雞）     鴴形目　Charadriiformes（涉禽）           鷺形類 Ardeae   水鳥類 Aequornithes（核心水鳥）     日鳽總目 Eurypgimorphae（日鳽、鷺鶴、熱帶鳥）     陸鳥類 Telluraves   非洲禽類 Afroaves     南鳥類 Australaves   （核心陸鳥）

Prum et al. (2015)[14]
夜鳥類 Strisores（蜂鳥、雨燕、夜鷹）       鴿鴇類   鴿形總目 Columbimorphae (鳩鴿、擬鶉、沙雞)     鴇形總目 Otidimorphae（杜鵑、鴇、蕉鵑）           鶴形目　Gruiformes（鶴、秧雞）     水濱鳥類 Aequorlitornithes     鴴形目　Charadriiformes（涉禽）     奇蹟鳥類 Mirandornithes（紅鶴、鸊鷉）     鷺形類 Ardeae   水鳥類 Aequornithes（核心水鳥）     日鳽總目 Eurypgimorphae（日鳽、鷺鶴、熱帶鳥）     (水鳥) 望外鳥類 Inopinaves   麝雉目 Opisthocomiformes（麝雉）     陸鳥類 Telluraves（核心陸鳥）

Suh (2016) ─a hard polytomy[12]
鴿形總目 Columbimorphae (鳩鴿、擬鶉、沙雞)     鴇形總目 Otidimorphae（杜鵑、鴇、蕉鵑）     夜鳥類 Strisores（蜂鳥、雨燕、夜鷹）     麝雉目 Opisthocomiformes（麝雉）     鶴形目　Gruiformes（鶴、秧雞）     鴴形目　Charadriiformes（涉禽）     奇蹟鳥類 Mirandornithes（紅鶴、鸊鷉）     鷺形類 Ardeae   水鳥類 Aequornithes（核心水鳥）     日鳽總目 Eurypgimorphae（日鳽、鷺鶴、熱帶鳥）         陸鳥類 Telluraves   非洲禽類 Afroaves     南鳥類 Australaves   （核心陸鳥）

新鳥小綱分化的不同提議比較

採用Braun & Kimball在2021年提出的總目分類樹，下面的分支圖說明所有新鳥小綱之下各目的擬議關係^[15]

新鳥小綱

奇蹟鳥類   火烈鳥目 Phoenicopteriformes     鷿鷈目 Podicipediformes   Mirandornithes 鴿形總目   鴿形目 Columbiformes       擬鶉目 Mesitornithiformes     沙雞目 Pterocliformes     Columbimorphae 雀類     鴇形目 Otidiformes     鵑形目 Cuculiformes       蕉鵑目 Musophagiformes     鶴形目 Gruiformes     鴴形目 Charadriiformes     麝雉目 Opisthocomiformes     夜鷹目 Caprimulgiformes   鷺形類 日鳽總目   鸏形目 Phaethontiformes     日鳽目 Eurypygiformes   Eurypygimorphae 水鳥類   潛鳥目 Gaviiformes[16]     南極鳥類   鸌形目 Procellariiformes     企鵝目 Sphenisciformes   Austrodyptornithes     鸛形目 Ciconiiformes       鰹鳥目 Suliformes     鵜形目 Pelecaniformes         Aequornithes Ardeae 陸鳥類 鷹形總目   美洲鷲目 Cathartiformes     鷹形目 Accipitriformes   Accipitrimorphae   鴞形目 Strigiformes   佛法僧總目   鼠鳥目 Coliiformes   穴鳥類   鵑鴗目 Leptosomiformes       咬鵑目 Trogoniformes   鴷翠鳥類   犀鳥目 Bucerotiformes   Picodynastornithes   佛法僧目 Coraciiformes     鴷形目 Piciformes     Picocoraciae   Cavitaves Coraciimorphae 南鳥類   叫鶴目 Cariamiformes   真隼形類   隼形目 Falconiformes   鸚雀總目   鸚形目 Psittaciformes     雀形目 Passeriformes   Psittacopasserae Eufalconimorphae Australaves Telluraves Passerea

Neoaves

參考文獻

1. Van Tuinen M. (2009) Birds (Aves). In The Timetree of Life, Hedges SB, Kumar S (eds). Oxford: Oxford University Press; 409–411.
2. Jarvis, E.D. (2014) Whole genome analyzes resolve the early branches in the tree of life of modern birds （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）.
3. Ericson, Per G.P.; et al. Diversification of Neoaves: integration of molecular sequence data and fossils (PDF). Biology Letters. 2006, 2 (4): 543–547 [2019-08-29]. PMC 1834003 . PMID 17148284. doi:10.1098/rsbl.2006.0523. （原始內容 (PDF)存檔於2009-03-25）.
4. McCormack, J.E.; et al. A phylogeny of birds based on over 1,500 loci collected by target enrichment and high-throughput sequencing. PLOS ONE. 2013, 8 (1): e54848 [2020-10-12]. doi:10.1371/journal.pone.0054848. （原始內容存檔於2020-05-05）.
5. Claramunt, S.; Cracraft, J. A new time tree reveals Earth history's imprint on the evolution of modern birds. Sci Adv. 2015, 1 (11): e1501005. PMC 4730849 . PMID 26824065. doi:10.1126/sciadv.1501005.
6. Mayr G. (2011) Metaves, Mirandornithes, Strisores and other novelties - a critical review of the higher-level phylogeny of neornithine birds （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）. J Zool Syst Evol Res. 49:58-76.
7. Matzke, A. et al. (2012) Retroposon insertion patterns of neoavian birds: strong evidence for an extensive incomplete lineage sorting era （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館） Mol. Biol. Evol.
8. Braun, Edward L.; Cracraft, Joel; Houde, Peter. Resolving the Avian Tree of Life from Top to Bottom: The Promise and Potential Boundaries of the Phylogenomic Era. Avian Genomics in Ecology and Evolution. 2019: 151–210. ISBN 978-3-030-16476-8. doi:10.1007/978-3-030-16477-5_6.
9. Jarvis, E.D.; et al. Whole-genome analyses resolve early branches in the tree of life of modern birds. Science. 2014, 346 (6215): 1320–1331 [2020-05-24]. PMC 4405904 . PMID 25504713. doi:10.1126/science.1253451. （原始內容存檔於2015-09-24）.
10. Prum, Richard O.; Berv, Jacob S.; Dornburg, Alex; Field, Daniel J.; Townsend, Jeffrey P.; Lemmon, Emily Moriarty; Lemmon, Alan R. A comprehensive phylogeny of birds (Aves) using targeted next-generation DNA sequencing. Nature. 2015, 526 (7574): 569–573. ISSN 0028-0836. PMID 26444237. doi:10.1038/nature15697.
11. Reddy, Sushma; Kimball, Rebecca T.; Pandey, Akanksha; Hosner, Peter A.; Braun, Michael J.; Hackett, Shannon J.; Han, Kin-Lan; Harshman, John; Huddleston, Christopher J.; Kingston, Sarah; Marks, Ben D.; Miglia, Kathleen J.; Moore, William S.; Sheldon, Frederick H.; Witt, Christopher C.; Yuri, Tamaki; Braun, Edward L. Why Do Phylogenomic Data Sets Yield Conflicting Trees? Data Type Influences the Avian Tree of Life more than Taxon Sampling. Systematic Biology. 2017, 66 (5): 857–879. ISSN 1063-5157. PMID 28369655. doi:10.1093/sysbio/syx041.
12. Suh, Alexander. The phylogenomic forest of bird trees contains a hard polytomy at the root of Neoaves. Zoologica Scripta. 2016, 45: 50–62. ISSN 0300-3256. doi:10.1111/zsc.12213.
13. Houde, Peter; Braun, Edward L.; Narula, Nitish; Minjares, Uriel; Mirarab, Siavash. Phylogenetic Signal of Indels and the Neoavian Radiation. Diversity. 2019, 11 (7): 108. ISSN 1424-2818. doi:10.3390/d11070108.
14. Prum, R.O.; et al. A comprehensive phylogeny of birds (Aves) using targeted next-generation DNA sequencing. Nature. 2015, 526: 569–573 [2020-05-24]. PMID 26444237. doi:10.1038/nature15697. （原始內容存檔於2020-05-29）.
15. Braun, E.L. & Kimball, R.T. (2021) Data types and the phylogeny of Neoaves. Birds, 2(1), 1-22; https://doi.org/10.3390/birds2010001 （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）
16. Boyd, John. NEORNITHES: 46 Orders (PDF). John Boyd's website. 2007 [30 December 2017]. （原始內容存檔 (PDF)於2010-08-06）.

外部連結

• Sushma Reddy （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）
• Alexander Suh