中美洲经贸办事处，是中美洲国家驻中华民国大使于1997年向中华民国外交部与行政院经济建设委员会提议设立，主要功能为推动基金会员国的经济发展与促进台湾在中美洲各国的投资商机，以加强中美洲邦交国与台湾的商业与外交关系。自2000年7月1日起，由中美洲经济发展基金支应营运经费，并由中华民国（台湾）与基金协定缔约国外交部长组成的董事会监督营运。