苏丹马末沙撤退至廖内省金宝(馬來語:Kabupaten Kampar), 并在1528年于当地驾崩。他有三个王子,分别为阿拉烏丁二世、穆扎法莎(馬來語:SultanMudzaffarShah I, Perak)和阿末莎。其长子,阿拉乌丁建立了柔佛苏丹王朝,而二儿子则被迎接至霹雳以统治当地并成为第一位来自马六甲王朝王族
现代柔佛苏丹王朝的血统可以追溯至南阿拉伯半岛的艾達魯斯(al-Aidarus)家族,这个家族曾经与马六甲苏丹王朝拥有过紧密的联婚关系。约在1812年,Sultan Mahmud ShahIII逝世后不久,不列颠与荷兰殖民者介入柔佛王位继承人的事务中,在英国的促使下,柔佛领土分别由柔佛苏丹(绝大多数的区域)、不列颠殖民者