Lin-4

lin-4是最早发现的microRNA，1993年由维克托·安布罗斯等人在模式生物秀丽隐杆线虫的基因组中发现。 ^[1][2] 这是第一个被发现的miRNA，是一类参与基因调控的非编码核糖核酸。^[3] miRNA转录形成70碱基的前体后由Dicer酶切割形成21碱基的产物^[4]。 发夹结构前体的范围一般不为人所知，是根据发夹结构预测来估计的。这些产物被认为通过与mRNA完全或部分互补而发挥调节作用。已发现lin-4基因位于一个单独宿主基因lho-1的 4.11kb 内含子内（参见[1] （页面存档备份，存于互联网档案馆））。

lin-4 microRNA precursor
预测的lin-4二级结构和保守序列
识别符
代号	lin-4
Rfam	RF00052
miRBase	MI0000002
miRBase	MIPF0000303
其他数据
RNA类型	Gene; miRNA
域	Eukaryota

转录

lin-4由自主miRNA启动子转录，并受发育调控，lin-4 miRNA积累发生在胚胎后发育的L2阶段。 此外，在lin-4成熟形式出现时，内源性lin-4 初级转录本也会上调。^[5] lin-4位于秀丽隐杆线虫的II号染色体上，与lin-14（英语：lin-14） mRNA 的3' 非转译区 (UTR)中的序列互补，该互补转录本含有7个结合位点以及9个核苷酸核心元素CUCAGGGAA。lin-4:lin-14双链体呈现出一种不寻常的扭结结构，这是由于碱基对不匹配导致凹槽尺寸和碱基堆积发生变化所致。^[5] 该lin-4:lin-14对与秀丽隐杆线虫中的IGF-1通路有关，与其发育的改变有关。^[6]

发育影响

lin-4决定线虫幼虫发育事件的开始。 lin-4功能丧失（lf）突变会导致发育迟缓，从最初的早期阶段到后期的幼虫阶段。后果包括异时期(heterochrony)发育模式，如外阴和成虫角质层结构的丧失。^[1]lin-4是lin-14的负性调节因子^[7][8]，抑制LIN-14蛋白质的累积。^[9]它也以lin-28为目标，并透过转译抑制来降低其蛋白质的表达。^[10]lin-4与目标之间的碱基配对是不连续的，由两个短螺旋组成。^[11]

参考文献

1. Lee RC, Feinbaum RL, Ambros V. The C. elegans heterochronic gene lin-4 encodes small RNAs with antisense complementarity to lin-14.. Cell. 1993, 75 (5): 843–854. PMID 8252621. doi:10.1016/0092-8674(93)90529-Y .
2. Rougvie, AE. Control of developmental timing in animals. Nat Rev Genet. 2001, 2 (9): 690–701. PMID 11533718. doi:10.1038/35088566.
3. Ambros, V. microRNAs: tiny regulators with great potential. Cell. 2001, 107 (7): 823–826. PMID 11779458. doi:10.1016/S0092-8674(01)00616-X .
4. Rougvie, AE. Control of developmental timing in animals. Nat Rev Genet. 2001, 2 (9): 690–701. PMID 11533718. doi:10.1038/35088566.
5. Balasubramanian C, Ojha RP, Maiti S, Desideri A. Sampling the structure of the noncanonical lin-4:lin-14 microRNA:mRNA complex by molecular dynamics simulations.. J Phys Chem B. 2010, 114 (49): 16443–9 [2024-10-20]. PMID 21090710. doi:10.1021/jp104193r. （原始内容存档于2024-12-11）.
6. Boehm M, Slack F. A developmental timing microRNA and its target regulate life span in C. elegans.. Science. 2005, 310 (5756): 1954–7 [2024-10-20]. PMID 16373574. doi:10.1126/science.1115596. （原始内容存档于2025-02-02）.
7. Ambros V, Horvitz HR. The lin-14 locus of Caenorhabditis elegans controls the time of expression of specific postembryonic developmental events.. Genes Dev. 1987, 1 (4): 398–414. PMID 3678829. doi:10.1101/gad.1.4.398 .
8. Ambros V. A hierarchy of regulatory genes controls a larva-to-adult developmental switch in C. elegans.. Cell. 1989, 57 (1): 49–57 [2024-12-31]. PMID 2702689. doi:10.1016/0092-8674(89)90171-2. （原始内容存档于2025-02-03）.
9. Olsen PH, Ambros V. The lin-4 regulatory RNA controls developmental timing in Caenorhabditis elegans by blocking LIN-14 protein synthesis after the initiation of translation.. Dev Biol. 1999, 216 (2): 671–80. PMID 10642801. doi:10.1006/dbio.1999.9523 .
10. Bagga S, Bracht J, Hunter S, Massirer K, Holtz J, Eachus R, et al. Regulation by let-7 and lin-4 miRNAs results in target mRNA degradation.. Cell. 2005, 122 (4): 553–63. PMID 16122423. doi:10.1016/j.cell.2005.07.031 .
11. Ambros V. microRNAs: tiny regulators with great potential.. Cell. 2001, 107 (7): 823–6. PMID 11779458. doi:10.1016/S0092-8674(01)00616-X .

外部链接

• lin-4 microRNA precursor的Rfam页面
• MirBase entry for lin-4