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自身抗体（英语：autoantibody）是一种抗体类型，它是指由免疫系统产生的针对个体自身的蛋白质、核酸等的抗体。许多自体免疫疾病，例如著名的红斑性狼疮，都是由自身抗体所引起的。
抗体一般是由于外来蛋白质或其他物质（尤其是致病菌）进入机体后由免疫系统产生，用于免疫反应以消灭外来的有害物质。通常情况下，免疫系统能够识别并忽视机体自身的细胞，并不对其产生抗体；同时，免疫系统也不会对环境中没有威胁的物质（如食物），产生过度反应。但是，在特定情况下，免疫系统对于机体自身的物质的识别失效，把它们认为是外来的入侵物，从而产生针对这些物质的抗体（即自身抗体），引发自体免疫。这些自身抗体会攻击机体自身的细胞、组织、器官，引起炎症反应，对机体造成损害。
| 抗体 | 相关疾病 |
| 抗双螺旋DNA | 系统性红斑狼疮 |
| 抗外切体复合物 | 硬化性肌炎 |
| 抗Ro或La蛋白 | 系统性红斑狼疮、婴儿房室阻滞、原发性干燥综合征 |
| 抗Smith抗原 | 系统性红斑狼疮 |
| 抗磷脂 | 抗磷脂综合征 |
| 抗单链退火蛋白或单链结合蛋白 | 干燥综合征 |
| 抗中性粒细胞细胞质 (c-ANCA) | 韦格纳肉芽肿 |
| 抗中性粒细胞核周 (p-ANCA) | 显微镜下型多血管炎、Churg-Strauss综合征、系统性血管炎 (非特异)、结节性多动脉炎（并未得到证实） |
| 抗IgG（类风湿因子） | 类风湿性关节炎 |
| 抗着丝粒 | 硬皮病 |
| 抗拓扑异构酶 | 硬皮病 |
| 抗平滑肌 | 慢性自免疫肝炎 |
| 抗线粒体 | 原发性胆汁性肝硬化 |
| 抗烟碱型乙酰胆碱受体 | 重症肌无力 |
| 抗电压控门钙离子通道 | Lambert-Eaton综合征 |
| 抗甲状腺过氧化物酶 (microsomal) | 桥本甲状腺炎 |
| 抗TSH受体 | 格雷夫斯病 |
| 抗Hu蛋白 | 副肿瘤性小脑综合征 |
| 抗电压控门钾离子通道 (VGKC) | 边缘叶脑炎 |
| 抗N-甲基-D-天冬氨酸受体 (NMDA) | 脑炎 |
- 自体免疫性疾病
- 抗嗜中性粒细胞质抗体（Anti-neutrophil cytoplasmic antibody）
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