1994年，以色列将大部分加沙地带的自治权交给巴勒斯坦民族权力机构（法塔赫）。[6]
2005年之前，加沙地带69%的土地与西岸的部分地区由巴勒斯坦民族权力机构管理，其他部分（主要是以色列公民居住的地方）则由以色列管理。由于巴勒斯坦民族权力机构不允许拥有正规军，治安由巴勒斯坦的公共治安队和民警负责。
2005年2月，以色列政府决定在夏天将以色列军队撤出加沙地带，并放弃所有以色列在加沙地带的定居点。撤军后，以色列将依然控制加沙地带的海岸线，以及加沙地带与埃及之间的一个狭长区域。但以色列国内对撤军计划有很大分歧。
2005年8月15日，以色列关闭加沙古什·卡提夫犹太定居点，正式撤出加沙。边境、海岸与领空依旧被以色列控制。
由于穆斯林居民在2006年巴勒斯坦立法委员会选举出的哈马斯政权坚持消灭以色列，因此加沙地带的边境、海岸与领空依旧被以色列重重封锁，水电基础设施的使用权亦依然被以色列严密管控[7]。
2007年6月，哈马斯通过加沙之战从法塔赫手中夺得加沙地带的控制权，自此法塔赫仅控制约旦河西岸地区，而加沙地带由哈马斯控制[8]。以色列从此开始严密封锁加沙地带，埃及亦关闭加沙地带南部的边界，居民只能依靠救济和从与埃及间的地道挣扎求生。国际救援组织前往加沙的援助车队则常在埃及受到阻挠，然而2010年5月的以色列军队袭击援助加沙船队的加沙船队冲突带来了更多变数[9]。
2008年加沙战争，哈马斯向以色列境内目标发射火箭弹和迫击炮，以色列则摧毁了包括警察局、监狱和哈马斯指挥中心等450个哈马斯目标。同时以色列北部也受到来自黎巴嫩方向发射的火箭弹袭击。空袭持续一周后，以色列于次年1月3日派出地面部队进入加沙地带。
2012年云柱行动，以色列国防军于11月14日开始在加沙地带展开的军事行动，以报复此前哈马斯方面对以色列南部城镇的袭击。
2012年，加沙地带与约旦河西岸地区作为巴勒斯坦国正式被联合国接纳为观察员国。[10]
2014年以巴冲突，以色列发动对加沙的大规模空袭，7月8日起在哈马斯统治加沙地带展开军事行动，在冲突进行了50天后，以色列与巴勒斯坦抵抗组织哈马斯已同意埃及提出的方案，从格林威治时间26日16时开始在加沙实施无限期停火，为50天来造成超过2,100多人死亡的加沙战事画下句号。
2011年5月，经埃及斡旋，法塔赫和哈马斯在埃及开罗签署和解协议。2012年2月，双方在卡塔尔签署《多哈协议》。2014年4月，双方宣布执行上述和解协议，但未能落实。
2017年9月17日，哈马斯宣布解散掌握加沙地带管理权的“行政委员会”，同意由巴勒斯坦政府接管加沙地带并行使行政权。9月25日，巴勒斯坦政府发言人优素福·穆罕默德在拉姆安拉宣布，巴勒斯坦总理拉米·哈马达拉与总统阿巴斯协商后决定，巴勒斯坦政府将于10月3日在加沙地带召开政府每周例会，而哈姆达拉和部分政府部长将在10月2日进入加沙地带，以便与控制加沙地带的哈马斯进行权力交接[8]，由此加沙地带的公务员工资将由巴勒斯坦民族权力机构支付。[11]10月12日，双方签署和解协议，但其后未能履行该协议。
2018至19年，大批巴勒斯坦人聚集在加沙边境示威，要求以色列当局让原居于以色列的巴勒斯坦人及其后代享有返回故乡定居的权利。
2021年5月，巴勒斯坦人再与以色列发生军事冲突。冲突起因是巴勒斯坦抗议者与以色列警方在东耶路撒冷谢赫·贾拉社区发生的冲突，引发以色列警方突袭位于圣殿山的阿克萨清真寺，造成约300名巴勒斯坦人受伤，从而引爆双方的军事冲突。后来在埃及的斡旋下，双方达成停火协议。
2022年破晓行动，以色列国防军在约旦河西岸以色列占领区的杰宁逮捕杰哈德领导人巴萨姆·萨阿迪，并先发制人地向加沙的武装分子和基础设施发动空袭。后来又经埃及调停，双方再次停火。
2023年10月，巴勒斯坦武装组织哈玛斯无预警发动代号为阿克萨洪水的恐怖袭击，从加沙发射逾5,000枚火箭弹袭击以色列，并派员进入其南部领土。[12][13][14][15]
2023年12月，阿拉伯国家在联合国安理会提案呼吁在加沙停火，但因美国行使否决权而未能通过决议。巴勒斯坦卫生部发言人表示，加沙巴人死亡人数已上升至17997人，受伤人数达到49229人。[16]
2024年3月25日，联合国安理会以14票赞成、1票弃权通过决议，要求以色列与哈玛斯于穆斯林斋戒月期间在加萨立即停火，并释放所有人质。[17][18]
