重庆清华中学渊源于清华大学，于民国27年由中国共产党元老董必武指示在重庆创建。因筹办者和主要任课教师均系清华大学校友，经清华大学校政当局和校友总会同意，学校命名为重庆清华中学，首任校长傅任敢先生亦为清华大学校长梅贻琦先生委派。中共建政后学校由政府接办，更名为“重庆市第九中学”（至今重庆民间有很多人仍然习惯称其为"九中"），1984年恢复“重庆清华中学”校名，周恩来夫人、全国政协主席邓颖超亲笔题写校名。