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《默克索引》（英语：Merck Index）是由美国默克公司出版的记录化学品、药物和生理性物质的综合性百科全书，收录超过一万多条有关个别的物质和其相关化合物的专题文章。本书亦于附录中收录有关有机化学的人名反应。默克索引亦设有订阅的电子检索形式，普遍被参考图书馆所采纳，以及在网上查阅的形式。有中译本。
默克索引于1889年首次出版，2013年起改由英国皇家化学学会（Royal Society of Chemistry）发行第15版，但仍维持原书名。
默克索引的专题文章函盖范围包括：
- 第一版（1889年）
- 第二版（1896年）
- 第三版（1907年）
- 第四版（1930年）
- 第五版（1940年）
- 第六版（1952年）
- 第七版（1960年）
- 第八版（1968年）
- 第九版（1976年）
- 第十版（1983年）ISBN 0-911910-27-1
- 第十一版（1989年）ISBN 0-911910-28-X
- 第十二版（1996年）ISBN 0-911910-12-3
- 第十三版（2001年）ISBN 0-911910-13-1
- 第十四版（2006年）ISBN 978-0-911910-00-1
- 第十五版（2013年）ISBN 978-1-84973670-1
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