Hyphochytriomycetes

不等鞭毛類，除下列分類還包括輻球蟲、蛙片蟲等。 金藻綱 硅鞭藻綱（Dictyochophyceae） 針胞藻綱（Raphidophyceae） 前毛壺菌綱（Hyphochytriomycetes） 卵菌綱 褐藻門，如海帶、巨藻、馬尾藻、墨角藻。 硅藻門 黃藻門 囊泡蟲類 頂複門，如瘧原蟲。 纖毛蟲類，如喇叭蟲、中縊蟲、榴彈蟲、草履蟲、四膜蟲。

金藻綱（Chrysophyceae） 硅鞭藻綱（Dictyochophyceae） 針胞藻綱（Raphidophyceae） 前毛壺菌綱（Hyphochytriomycetes） 卵菌綱（Oomycetes） 褐藻門（Phaeophyceae），如海帶、巨藻、馬尾藻、墨角藻。 硅藻門（Bacillariophyta）

†Stephanolithiales †Watznaueriales Pavlovophyceae Pavlovales 纲未定及环境样本 Hyphochytriomycetes Hyphochytriales Labyrinthulomycetes Labyrinthulales Thraustochytriales

金藻綱（Chrysophyceae） 硅鞭藻綱（Dictyochophyceae） 針胞藻綱（Raphidophyceae） 前毛壺菌綱（Hyphochytriomycetes） 卵菌綱（Oomycetes） 褐藻門（Phaeophyceae），如海帶、巨藻、馬尾藻、墨角藻。 硅藻門（Bacillariophyta）

Eumycotina 根肿菌纲 Plasmodiophoromycetes 壶菌纲 Chytridiomycetes 丝壶菌纲 Hyphochytriomycetes 卵菌纲 Oomycetes 接合菌纲 Zygomycetes 毛菌纲 Trichomycetes 子囊菌纲 Ascomycetes