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ChIP-chip
来自维基百科,自由的百科全书
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染色质免疫沉淀-测序
染色质免疫沉淀-测序(英語:
ChIP
-sequencing,简称为
ChIP
-seq)被用于分析蛋白质与DNA的交互作用。该技术将染色质免疫沉淀(
ChIP
)与大规模并行DNA测序结合起来以鉴定与DNA相关蛋白的结合部位。其可被用于精确绘制任意目的蛋白在全基因组上的结合位点。在此之前,
ChIP
-on-
chip
是研究这些蛋白-DNA联系的最常用的技术。
蛋白质方法
BCA蛋白质测定 蛋白质印迹 分光光度法 酶活性测定 蛋白质分离 色谱法 凝胶电泳 等电聚焦 X射线晶体学 蛋白质核磁共振波谱法
ChIP
-on-
chip
Chip
-Sequencing DamID 微型热迁移 氢-氘交换 质谱法 分子动力学 蛋白质结构预测 蛋白质测序 蛋白质结构比对 蛋白质本体论
顺反组
enome(基因组)的混成詞,最初由达纳-法伯癌症研究所和哈佛医学院的研究者命名。 染色质免疫沉淀等技术结合微阵列分析“
ChIP
-on-
chip
”或大规模并行DNA测序“
ChIP
-Seq”极大地方便了对转录因子及其它染色质相关蛋白的顺反组的定义。 Liu T, Ortiz JA, Taing L,
Ρ因子
新产生的RNA从三元转录复合物中解离出来,进而停止转录。 2009年大约有200个ρ终止基因座(Rho-terminated loci)通过
ChIP
-
chip
实验被验证。 Slonczewski, Joan, and John Watkins. Foster. Microbiology: An Evolving
染色质免疫沉淀
染色质免疫沉淀(英語:Chromatin Immunoprecipitation,简称为
ChIP
)被用来研究细胞内DNA与蛋白质相互作用,具体来说就是确定特定蛋白(如转录因子)是否结合特定基因组区域(如启动子或其它DNA结合位点)——可能定义顺反组。
ChIP
还被用来确定基因组上与组蛋白修饰相关的特定位点(即组蛋白修饰酶类的标靶)。