外毛菌目本目原本隸屬於真菌界毛菌綱,但後來分子證據證明其和動物界的親緣關係比和真菌來得接近,因此在毛菌綱拆分後和變形毛菌目(英语:Amoebidiales)一同被歸入動物總界下的中菌動物中。 本目包括以下科: 变形毛菌科 Amoebidiidae Creolimacidae Eccrinidae
後鞭毛生物Mesomycetozoea 肤胞虫目 Dermocystida 鱼孢霉目 Ichthyophonida 外毛菌目 Eccrinales 变形毛菌目 Amoebidiales 珊瑚壶菌属 Corallochytrium 蜷丝生物 Filozoa 蜷丝球虫纲 Filasterea 快孢子虫目 Capsasporida
毛菌綱內孢毛菌目 Asellariales 鉤孢毛菌目 Harpellales 外毛菌目 Eccrinales 變形毛菌目 Amoebidiales 基於分子證據,本分類單元目前已廢棄不用。內孢毛菌目和鉤孢毛菌目現時被歸入梳黴亞門中,而外毛菌目和變形毛菌目則被發現其和動物的親緣關係比和
原生生物分類表Corallochytrida Cristidiscoidea Ministeriida Nucleariida Mesomycetozoea Amoebidiales Dermocystida Eccrinales Ichthyophonida 目未定 纲未定 Chromeraceae Chromera
真菌菌的姊妹群,與現生真菌關係非常密切。不過關於這些生物的研究有時仍被視為真菌學的範疇,出現在真菌學的課本與論文中。 外毛菌、變形毛菌(英语:Amoebidiales)、魚孢菌(英语:Ichthyophonus)與珊瑚壺菌(英语:Corallochytrium)原本歸屬接合菌門,後來發現它們屬於動物總界