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食物不耐症（food intolerances）是指因为食物、饮料、食品添加剂或是食物中成分产生的有害反应，一般会在食用食物之后一段时间才会出现，有害反应会在一个或多个器官或是系统出现，但一般是指食物过敏以外的反应。虽然不耐与过敏同是食物敏感（Food hypersensitivity）的症状，但和食物过敏不同的是，食物不耐的症状往往在食用食物之后一段时间才会出现。
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食物不耐症可以依其机制来分类。食物不耐症可以因为缺乏消化特定食物需要的化合物或酵素而产生：例如遗传性果糖不耐症；也有可能是因为身体无法吸收特定营素所造成，例如果糖吸收不良；也可能是因为食物中自然存在的化学物质而造成：例如水杨酸敏感的人，对于从植物提炼的药物（例如阿司匹林）也会引起这类不耐症；可能是无IgE介导的免疫反应的结果。
食物不耐反应包括了对食物或食物中成分的药理学反应、代谢反应或是肠胃反应。食物不耐不包括心理性的反应[1]，也不包括食源性疾病。
非过敏性的食物敏感（food hypersensitivity）是异常的生理反应。很可能很难区分哪一种物质造成食物不耐，因为反应可能比较晚、是否有反应和剂量有关、也有可能会引起特定反应的物质在许多食物中都有[2]。
- 代谢性食物反应是因为遗传性或是后天的代谢缺陷所造成，例如乳糖不耐、苯丙酮尿症及葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症（蚕豆症）。
- 药理学反应是因为食物中含有的低分子量化学物质，例如水杨酸敏感、胺或是味精，或是对防腐剂、色素、乳化剂以及增味剂等食品添加剂的反应。这些物质可能会对一些人造成类似药物的副作用[3]。
- 肠胃（GI）反应可能是因为吸收不良或是其他肠胃道的异常。
- 免疫反应是因为免疫系统将特定食物视为外来物质，可以透过非IgE的免疫球蛋白调整。
- 毒素可能是食物中本来就有的、细菌产生的，或是因为食品污染而造成的[3]。毒性食品反应可能是因为食品或物质的直接反应，和免疫系统无关[3]。
- 心理反应不是因为食物造成的，是因为食物而引发的情绪造成。只有食物在特定形式下提供才会出现此一症状[3]。
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