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原生生物中的一類 来自维基百科，自由的百科全书
藻类（algae）是一个非正式术语，泛指所有非植物的光合自营真核生物，是一个由多个不同演化支（支序群）组成的复系群。所有藻类细胞都有含有叶绿素的色素体——叶绿体，源自被内共生的蓝绿菌，但在分类上各自属于独立的演化支，其内共生事件也发生在不同时期。虽然植物也演化自淡水藻类的一支，藻类普遍都缺乏真正意义上根、茎、叶和其他可在高等植物上发现的组织构造（如维管束），但一些较为高级的藻类会拥有与植物叶子功能相似的假叶（phyllid）。
藻类并不构成独立的一个界，而是分散于真核域中的数个界，是真核生物中最为基群的群体之一。属于原生生物界的藻类有裸藻、甲藻（或称涡鞭毛藻）、隐藻、金藻、硅藻、红藻、绿藻和褐藻；而生殖构造复杂的轮藻则属于植物界。绝大多数藻类都是水生，其中多数都是肉眼无法看见的浮游“微藻”（即所谓的“浮游植物”），宏观可见的一般仅有红藻、石莼纲绿藻、轮藻和褐藻等固着性大型藻类。此类大型藻99%以上都栖息于海洋生态系统中，故统一俗称“海藻”；而剩下的栖息在淡水生态系统的大型藻类则俗称“水藻”。
藻类在自然界中拥有庞大生物质，人类许多传统活动以及工业应用都会用到藻类。传统的藻类养殖已进行了上千年，其中海带和紫菜等大型藻是东亚饮食文化中的传统海产。近来除了可食用藻类之外，藻类还有其他的农艺应用，例如作牲畜饲料、用作生物修复或污染控制、将太阳能转换为藻类生质燃料或是其他工业上会用到的化学品，以及医学或是科技上的应用。2020的回顾报告发现，藻类可以在碳截存上发挥重要作用，缓解气候变化的同时也为全球的经济体提供加值的商品[3]。
藻类在水里非常常见，在陆域环境也是。然而陆域藻类通常较不显眼，且于潮湿、热带地区比干燥地区更常见，因为藻类缺乏维管束和其他营陆地生活的适应构造。藻类在其他地点如雪地或以地衣的形式在裸露岩石表面与真菌共生。
种类繁复的藻类在水域生态系扮演重要角色。微观下悬浮于水柱者﹝浮游植物﹞提供食物给大多数海洋食物链。当藻类密度非常高﹝水华﹞时，可能使水变色，与其他生物竞争或使其他生物中毒或窒息。海草大部分生长在浅海水中，然而有些已有生长于300米深的纪录。[4]有些供人类食用或生产有用物质如洋菜、鹿角菜胶或肥料。
研究海洋或淡水藻类的学科称为藻类学。
虽然传统上将蓝绿菌归于藻类，称为“蓝绿藻门”（Cyanophyte），但近年研究通常将它排除，因为蓝绿菌作为一种革兰氏阴性菌其实是原核生物，和属于真核生物的藻类差异甚大，诸如缺乏生物膜包裹的胞器、含有单一环状染色体、细胞壁含有肽聚糖、核糖体大小和成分都与真核生物不同[5][6]。蓝绿菌在特化折叠的原生质膜（称为叶绿囊膜）上行光合作用。因此，它们即使拥有类似的生态区位，彼此仍然差异很大所以现时被归属细菌界中。
爱尔兰植物学家威廉•亨利•哈维（1811~1866） 首先根据色素将藻类分为四类，首次将生化准则用于植物分类，其四类为：红藻、褐藻、绿藻和硅藻。[7]
依现在的定义，藻类是真核生物，在称为叶绿体的膜状胞器内行光合作用。叶绿体内含环状DNA，结构和蓝绿藻相似，可能代表退化的蓝绿藻内共生胞器。各演化系（lineage）藻类叶绿体的确切特性均不相同，反映出不同的内共生事件。下表列出三个主要群组，它们的演化系关系表示于左侧。需注意许多群组均包含不再行光合作用的成员。有些仍保有色素体但非叶绿体，有些则已经完全丧失。
种系发生：[8]
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蓝藻 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 主要群组 | 成员 | 内共生体 | 说明 |
|---|---|---|---|
| 广义植物/ 原始色素体生物 |
蓝绿藻 | 含有初级叶绿体,i.e，叶绿体由双层膜包围，可能源自单一内共生事件。红藻的叶绿体含叶绿素a和d（通常），和藻胆素，而绿藻的含叶绿素a和b。高等植物的色素近似绿藻，可能由绿藻演化而来。所以绿藻门是植物界的亲近分类，有时会归类为绿植界（Virdiplantae）。 | |
| 古虫界与有孔虫界 |
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绿藻 | 拥有内含叶绿素a和b的绿色叶绿体[5]。叶绿体被3或4层膜包围，可能分别源自吞入的绿藻。
绿蛛网藻，属于丝足虫门。包含小型的类核体，其为藻类细胞核的残余。 裸藻纲，属于眼虫门。主要生活于淡水，叶绿体有3层膜。有人认为其内共生绿藻是经由myzocytosis而非吞噬作用（phagocytosis） |
| 色藻界和囊泡虫类 | 红藻 | 拥有内含叶绿素a和c、藻胆素的叶绿体。后者叶绿素型态无法从原核生物或初级叶绿体得知，但是与红藻基因相似性支持其关系存在。
属于色藻界的前三类，叶绿体有4层膜，隐藻残留有类核体，他们很可能共同拥有含有色素的祖先。然而其他证据质疑这种说法，不等鞭毛类、定鞭藻和隐藻之间的关系是否比和其他类的关系更接近[9][10]。 典型甲藻类的叶绿体有3层膜，但是其叶绿体非常多样，且显示曾有数次内共生事件[11]。顶复门，一组关系十分接近的寄生生物，也有称为顶复体 （Apicoplast）的色素体。顶复体无法行光合作用，但是显示出和甲藻类叶绿体有共同起源[11]。 |
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