巴南区是重庆市的市辖区，是主城九区之一。原为巴县，历史悠久，历史上曾经是重庆政府的驻地，著名革命志士邹容就是巴县人，区政府驻地在龙洲湾街道（由鱼洞街道迁来）。
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周慎靓王五年（公元前316年）秦灭巴国，周赧王元年（公元前314年）秦在巴国旧域设县治理，江州县为其一，隶于巴郡。南齐永明五年（公元487年），改江州县为垫江县，北周武成三年（561年）又改垫江县为巴县，并废枳县入于巴县。
国府时期的很长一段时间内，巴县都是重庆的工业中心和富人区。抗战时重庆遭受大轰炸，渝中半岛被日军炸为平地，中央国民政府实际驻地便在巴南区。中华人民共和国成立后，商业中心北移，巴南区经济退出重庆市前三位，1994年12月，撤县建立巴南区。
巴南区地形以丘陵为主，低山次之，平地极少，分别占总幅员面积的62.27%、32.99%和4.64%。地势南高北低，北部边缘的麻柳嘴镇华光村冉家湾海拔154米，为区的最低点，东南边境的石滩镇方斗山海拔1132.60米，为最高点。境内山峦起伏，多数为1000米以下的低山，有云篆山、燕尾山脉、樵坪山、白庙子山、天井坪山脉、桃子荡山脉、茶坪山脉、丰盛山脉、石油沟山脉、太公山山脉、石岭岗山脉11座山和山脉。
全区雨量充沛，多年平均地表水径流量10.56亿立方米，地下水补给量1.05亿立方米，长江过境水流1.70亿立方米，另有流经境内的五布河等大小河流10余条，全境流域总面积1700多平方公里。
矿产资源数十种，曾先后开发利用的有原煤、铁矿、石油、天然气、页岩、石灰石、白云石、石英砂、钾土、砂金、地热水等。现有多家页岩砖厂，对页岩的开发利用数量较大；地热水的出水点较多，已有东泉、南泉、桥口坝等地多处开发利用；石灰石、白云石、石英砂和钾土、砂金等资源的开采，成为当地村民利用矿产开发致富的优势资源。[2]
四川省人民政府川府民政(1993)49号《关于巴县区乡镇建制调整的批复》
- (一)撤销铜罐驿、白市驿，虎溪、青木关、长生桥、不洞、姜家，接龙、一品，界石等十个区公所
- (二)撤销元明、陶家，跳蹬、长石、松岭，巴碯，走马、主风、含谷，虎溪，曾家。止主。西永、五屏，新店子，凤凰，回龙坝、保农、三桥、天文、鹿角、樵坪、迎龙、东永、惠民、木洞、长坪、仰山、栋青、丰盛、马家、双河口、羊鹿、麻柳嘴、天池．姜家、太和、竹林、二圣、天坪、五布、东泉、双胜、天赐、芦沟、接龙、南沱、小观、花石、石滩、石龙、长岭岗、安澜、跳石、石林、石庙、百节、南彭、月华、公平等六十个乡和白沙沱镇。
- (三)新建三十六个镇：
- 陶家镇，镇人民政府驻陶家场。辖原陶家乡所属行政区域。
- 跳蹬镇，镇人民政府驻跳蹬场。辖原跳蹬乡、白沙沱镇所属行政区域。
- 巴福镇，镇人民政府驻巴福场。辖原巴福乡所属行政区域。
- 走马镇，镇人民政府驻走马场。辖原走马乡所属行政区域。
- 金凤镇，镇人民政府驻金凤场。辖原金凤乡所厉行政区域。
- 含谷镇，镇人民政府驻含谷场。辖原含谷乡所属行政区域。
- 曾家镇，镇人民政府驻曾家场。辖原曾家乡所属行政区域。
- 虎溪镇，镇人民政府驻虎溪场。辖原虎溪乡所属行政区域。
- 西永镇，镇人民政府驻西永场。辖原西永乡所属行政区域。
- 土主镇，镇人民政府驻土主场。辖原土主乡所属行政区域。
- 凤凰镇，镇人民政府驻凤凰场。辖原凤凰乡所属行政区域。
- 回龙坝镇，镇人民政府驻兴隆场。辖原回龙坝乡、三桥乡、保农乡所属行政区域。
- 鹿角镇，镇人民政府驻鹿角场。辖原鹿角乡、樵坪乡所属行政区域。
- 迎龙镇，镇人民政府驻迎龙场。辖原迎龙乡所属行政区域。
- 惠民镇，镇人民政府驻惠民场。辖原惠民乡、东永乡所属行政区域。
- 青山镇，镇人民政府驻仰山场。辖原仰山乡、栋青乡所属行政区域。
- 丰盛镇，镇人民政府驻丰盛场。辖原丰盛乡、马家乡所属行政区域。
- 双河口镇，镇人民政府驻双河口场。辖原双河口乡、羊鹿乡所属行政区域。
- 麻柳嘴镇，镇人民政府驻麻柳嘴场。辖原麻柳嘴乡、大池乡所属行政区域。
- 二圣镇，镇人民政府驻二圣场。辖原-：圣乡、大坪乡所履行政区域。
- 五布镇，镇人民政府驻五布场。辖原五布乡所屈行政区域。
- 东泉镇，镇人民政府驻东泉场。辖原东泉乡，双胜乡听属行政区域。
- 姜家镇，镇人民政府驻姜家场。辖原姜家乡所属行政区域。
- 天星寺镇，镇人民政府驻太和场。辖原太和乡、竹林乡所属行政区域。
- 天赐镇，镇人民政府驻天赐场。辖原天赐乡、芦沟乡所属行政区域。
- 接龙镇，镇人民政府驻塘边坝。辖原按龙乡，南沱乡听厉行政区域。
- 小观镇，镇人民政府驻小现场。辖原小观乡所属行政区域。
- 花石镇，镇人民政府驻花石场。辖原花石乡所属行政区域。
- 石龙镇，镇人民政府驻石龙场。辖原石龙乡：长岭岗乡所属行政区域。；
- 石滩镇，镇人民政府驻石滩场，辖原石滩乡所属行政区域。
- 安澜镇，镇人民政府驻安澜场。辖原安澜乡所属行政区域。
- 跳石镇，镇人民政府驻跳石场。辖原跳石乡、石林乡所属行政区域。
- 圣灯山镇，镇人民政府驻石庙场。辖原石庙乡所届行政区域。
- 百节镇，镇人民政府驻百节场。辖原百节乡所属行政区域。
- 南彭镇，镇人民政府驻南彭场。辖原南彭乡、月华乡所属行政区域。
- 公平镇，镇人民政府驻公平场；辖原公平乡所属行政区域。
- 西彭镇，将原元明乡、长石乡所属行政区域划归西彭镇管辖。
- 白市驿镇，将原松岭乡所属行政区域划归白市驿镇管辖。
- 陈家桥镇，将原玉屏乡所属行政区域划归陈家桥镇管辖。
- 长生桥镇，将原天文乡所属行政区域划归长生桥镇管辖。
- 木洞镇，将原木洞乡、长坪乡所属行政区域划归木洞镇管辖。
- 中梁乡，乡人民政府驻地新店子，将原新店子乡所属行政区域划归中梁乡管辖。
- (五)保留铜罐驿、青木、广阳、一品、界石、鱼洞等六镇和石板、清溪、清和、凉水、双新、和平桥、白鹤塘、龙岗、陈家、仁流、南龙、忠兴、石岗等十三乡，其政府驻地和行政区域不变。
1994年12月17日经国务院批准撤县建立巴南区，1995年1月18日重庆市政府行文通知，巴南区辖原巴县的鱼洞、鹿角、惠民、林洞、青山、丰盛、双河口、麻柳嘴、二圣、五布、乐泉、姜家、天星寺、天赐、接龙、小观、花石、石龙、石滩、一品、安澜、跳石、圣灯山、百节、界石、南彭、公平27个镇和清溪、清和、白鹤塘、凉水、双新、和平桥、龙岗、陈家、仁流、南龙、忠兴、石岗12个乡，从九龙坡区划入的李家沱、土桥２个街道办事处和花溪、南泉2个镇。1995年2月28日正式成立。
- 长生桥、迎龙、广阳3个镇及九龙坡区划入的花溪镇二塘村划入南岸区。
- 陈家桥、曾家、虎溪、西永、土主、青木关、凤凰、回龙坝8个镇和中梁乡划入沙坪坝区。
- 跳蹬镇划入大渡口区。
- 西彭、铜罐驿、陶家、白市驿、巴福、走马、金凤、含谷8个镇和石板乡划入九龙坡区。
2001年7月12日，重庆市人民政府（渝府[2001]140号）同意巴南区将2个街道办事处、29个镇、12个乡调整为2个街道办事处、19个镇。调整后，街道办事处和镇平均面积由调整前的42.4平方千米扩大至86.9平方千米，平均人口由调整前的20028人增至41009人。
- 一、撤销土桥街道和鱼洞、百节、鹿角、公平、青山、小观、花石、五布、天赐、圣灯山等10个镇及清溪、和平桥、双新、凉水、清和、白鹤塘、忠兴、石岗、陈家、仁流、龙岗、南龙等12个乡。
- 二、扩大14个镇的行政区域
- 花溪镇：政府驻地花溪新村5号，管辖原土桥街道和花溪镇所属行政区域。面积47.61平方千米，总人口77554人，其中非农业人口43872人，辖11个行政村，23个居委会。
- 南泉镇：政府驻地南泉正街68号，管辖原南泉镇和鹿角镇所属行政区域。面积84.46平方千米，总人口42679人，其中非农业人口5210人，辖18个行政村，4个居委会。
- 界石镇：政府驻地界石场，管辖原界石镇和公平镇（除蒋家坪村外）所属行政区域。面积60.36平方千米，总人口38845人，其中非农业人口6137人，辖15个行政村，4个居委会。
- 南彭镇：政府驻地南彭场，管辖原南彭镇、忠兴乡、石岗乡所属行政区域。面积126.9平方千米，总人口54109人，其中非农业人口1842人，辖26个行政村，4个居委会。
- 木洞镇：政府驻地木洞场，管辖原木洞镇、青山镇所属行政区域。面积104.3平方千米，总人口46194人，其中非农业人口7159人，辖28个行政村，8个居委会。
- 麻柳嘴镇：政府驻地麻柳嘴场，管辖原麻柳嘴镇、清溪乡所属行政区域。面积77.94平方千米，总人口27735人，其中非农业人口856人，辖16个行政村，1个居委会。
- 东泉镇：政府驻地东泉场，管辖原东泉镇、五布镇、天赐镇、清和乡（除洞子坝村、大园村外）所属行政区域。面积122.7平方千米，总人口38846人，其中非农业人口2483人，辖26个行政村，6个居委会。
- 姜家镇：政府驻地姜家场，管辖原姜家镇、白鹤塘乡所属行政区域。面积80.36平方千米，总人口24198人，其中非农业人口1591人，辖14个行政村，2个居委会。
- 接龙镇：政府驻地接龙场，管辖原接龙镇、小观镇、和平桥乡、双新乡、凉水乡（除双寨村外）所属行政区域。面积151.53平方千米，总人口49281人，其中非农业人口2699人，辖29个行政村，2个居委会。
- 石滩镇：政府驻地石滩场，管辖原石滩镇、花石镇的盐井村、天台村和凉水乡的双寨村所属行政区域。面积47.43平方千米，总人口14436人，其中非农业人口332人，辖8个行政村，1个居委会。
- 石龙镇：政府驻地石龙场，管辖原石龙镇、花石镇（盐井村、天台村除外）和清和乡的洞子坝村、大园村所属行政区域。面积110.79平方千米，总人口32521人，其中非农业人口963人，辖19个行政村，2个居委会。
- 一品镇：政府驻地一品场，管辖原一品镇、公平镇蒋家坪村所属行政区域。面积57.94平方千米，总人口22887人，其中非农业人口4296人，辖8个行政村，2个居委会。
- 跳石镇：政府驻地跳石场，管辖原跳石镇、陈家乡、圣灯山镇和仁流乡的肖家村、大佛村所属行政区域。面积136.34平方千米，总人口38976人，其中非农业人口1270人，辖24个行政村，3个居委会。
- 安澜镇：政府驻地安澜场，管辖原安澜镇、仁流乡（除肖家村、大佛村外）、龙岗乡和南龙乡所属行政区域。面积122.42平方千米，总人口41179人，其中非农业人口1824人，辖26个行政村，5个居委会。
- 三、新建鱼洞街道办事处。办事处驻地鱼洞鱼轻路27号，管辖原鱼洞镇、百节镇所属行政区域。面积96.71平方千米，总人口148912人，其中非农业人口103050人，辖25个行政村，27个居委会。
- 四、保留李家沱街道办事处和惠民、双河口、丰盛、二圣、天星寺等5个镇行政区域不变。
- 2002年11月20日，将石龙镇后沟村划归石滩镇管辖。
- 调整后，石龙镇面积106.31平方千米，总人口31189人；石滩镇面积52.09平方千米，总人口15768人（渝府[2002]193号）。
- 2002年，巴南区辖2个街道办事处（李家沱、渔洞）、19个镇（花溪、南泉、惠民、木洞、麻柳嘴、双河口、丰盛、东泉、姜家、天星寺、二圣、接龙、石滩、石龙、一品、安澜、跳石、界石、南彭），76个居委会、341个行政村。2002年末户籍总人口85.73万人，其中非农业人口23.71万人。
- 2008年，全区辖2个街道、19个镇：鱼洞街道、李家沱街道、花溪镇、南泉镇、界石镇、一品镇、南彭镇、惠民镇、安澜镇、跳石镇、木洞镇、双河口镇、麻柳嘴镇、丰盛镇、二圣镇、东泉镇、姜家镇、天星寺镇、接龙镇、石滩镇、石龙镇。区政府驻鱼洞街道。
重庆市人民政府《关于巴南区行政区划调整的批复》（渝府[2009]33号二○○九年三月二日）
巴南区人民政府： 你区《关于镇街行政区划建制调整的请示》（巴南府文[2009]30号）收悉。市政府原则同意你区行政区划调整方案。现批复如下：
- 一、撤销5个镇 花溪镇、南泉镇、南彭镇、惠民镇、一品镇。
- 二、调整2个街道的行政区域范围
- （一）李家沱街道：辖原李家沱街道（陈家湾社区除外）行政区域和原花溪镇的其龙村、群乐村、光明村和其龙社区。调整后，李家沱街道幅员面积为11.2平方公里，办事处驻李家沱林荫村205号（原址）。
- （二）鱼洞街道：辖原鱼洞街道（解放村、独龙桥村、红炉村、团结村、盘龙村、沿河村、桥口坝村和梅家梁社区、百节社区除外）行政区域。调整后，鱼洞街道幅员面积55.6平方公里，办事处驻鱼洞鱼轻路27号（原址）。
- 三、设立6个街道
- （一）龙洲湾街道：辖原鱼洞街道的解放村、独龙桥村、红炉村、团结村、盘龙村、沿河村、梅家梁社区、百节社区以及原花溪镇的道角村。调整后，龙洲湾街道幅员面积为39.5平方公里，办事处驻渝南大道。
- （二）花溪街道：辖原花溪镇（道角村、其龙村、群乐村、光明村和其龙社区除外）行政区域和原李家沱街道的陈家湾社区。调整后，花溪街道幅员面积为33.5平方公里，办事处驻花溪新村5号（原花溪镇政府驻地）。
- （三）南泉街道：辖原南泉镇行政区域。调整后，南泉街道幅员面积为84.5平方公里，办事处驻鹿角场富源街67号（原南泉镇政府驻地）。
- （四）南彭街道：辖原南彭镇行政区域。调整后，南彭街道幅员面积为126.9平方公里，办事处驻南忠路40号（原南彭镇政府驻地）。
- （五）惠民街道：辖原惠民镇行政区域。调整后，惠民街道幅员面积为63.2平方公里，办事处驻惠民正街115号（原惠民镇政府驻地）。
- （六）一品街道：辖原一品镇行政区域和原鱼洞街道的桥口坝村。调整后，一品街道幅员面积为58.9平方公里，办事处驻一品新街16号（原一品镇政府驻地）。
- 四、保留14个镇的行政区域和政府驻地不变：界石镇、木洞镇、双河口镇、麻柳嘴镇、丰盛镇、二圣镇、东温泉镇、姜家镇、天星寺镇、接龙镇、石滩镇、石龙镇、跳石镇、安澜镇。
调整后，巴南区共辖22个镇街，其中14个镇、8个街道。
- 南温泉风景区
- 东温泉风景区
- 桥口坝温泉风景区
- 圣灯山森林公园
- 云篆山森林公园
- 樵坪山庄
- 蒋介石故居
- 孔祥熙故居
- 丰盛古镇
巴南区既是工业大区，又是农业大区。重要企业有重庆大江集团，重庆长安铃木公司，宗申产业集团，重庆机床厂，重庆华陶养瓷业，重庆万里蓄电池股份有限公司，重庆渝港钛白粉股份有限公司，重钢集团钢管有限责任公司等全国知名的大中型企业。名优农副产品有木洞蜜枣、木洞油酥鸭、五布柚、二圣茶叶、石林茶叶等。
巴南区内高校有：
- 重庆理工大学花溪校区（位于李家沱红光）；
- 重庆正大软件职业技术学院（位于南泉）；
- 重庆工程职业技术学院巴南校区（该校区已经搬迁至重庆市江津区）。
巴南区内完全中学有（不完整）：
重庆市实验中学校
重庆市接龙中学校
重庆市渝南田家炳中学校
重庆市第十中学校
重庆市大江中学校
木洞中学
重庆市巴南中学校（原重庆市第三十四中学校）
重庆市清华中学校（原重庆市第九中学）
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