UniProt

联合的蛋白
内容
有机体	所有
相关信息
研究中心	英国EMBL-EBI、瑞士SIB（英语：Swiss Institute of Bioinformatics）、美国PIR（英语：Protein Information Resource）
访问入口
数据格式	Custom flat file, FASTA（英语：FASTA）, GFF（英语：GFF）, RDF, XML.
网站	www.uniprot.org
下载地址	www.uniprot.org/downloads&用于下载完整的数据集ftp.uniprot.org
网络服务地址	是 – JAVA应用程序接口在这里看到信息&表达层状态转换在这里看到信息
工具
Web	高级搜索，BLAST，ClustalO，批量检索/下载，ID映射
其他
许可	创作共享署名-禁止改作
版本	是
数据发布频率	4周一次
管理政策	是 – 手动和自动。数据库监护人和计算算法生成的自动注释规则。
可否列为书签	是 – 个别蛋白质条目和搜索

UniProt（联合的蛋白）是一个全面的，高质量的，免费使用的蛋白质序列与功能信息数据库，许多内容来自基因组计划，它还包含了大量来自研究文献的关于蛋白的生物学功能信息。

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UniProt共同体由欧洲生物信息研究所, 瑞士生物信息研究所（英语：Swiss Institute of Bioinformatics），以及美国Protein Information Resource（英语：Protein Information Resource）组成。欧洲生物信息研究所坐落于英国茵格斯顿（英语：Hinxton）的Wellcome Trust Genome Campus（英语：Wellcome Trust Genome Campus），拥有大量的生物信息学数据库及服务资源。瑞士生物信息研究所位于瑞士的日内瓦，维持专家蛋白质分析系统（英语：ExPASy）（Expert Protein Analysis System，一个蛋白质组学工具和数据库资源中心）服务器的运作。2002年，EBI，SIB和PIR联合成为UniProt共同体^[1]。

每个共同体成员都积极参与蛋白质数据库维护和注释。直到最近，EBI和SIB一起生产了Swiss-Prot和TrEMBL数据库，而PIR生产了蛋白质序列数据库（PIR-PSD）^[2]^[3]^[4]。这些数据库与不同的蛋白质序列覆盖和注释优先级共存。

[1]
2002 Release: NHGRI Funds Global Protein Database. National Human Genome Research Institute (NHGRI). [14 April 2018]. （原始内容存档于2015-09-24）.
[2]
O'Donovan, C.; Martin, M. J.; Gattiker, A.; Gasteiger, E.; Bairoch, A.; Apweiler, R. High-quality protein knowledge resource: SWISS-PROT and TrEMBL. Briefings in Bioinformatics. 2002, 3 (3): 275–284. PMID 12230036. doi:10.1093/bib/3.3.275.
[3]
Wu, C. H.; Yeh, L. S.; Huang, H.; Arminski, L.; Castro-Alvear, J.; Chen, Y.; Hu, Z.; Kourtesis, P.; Ledley, R. S.; Suzek, B. E.; Vinayaka, C. R.; Zhang, J.; Barker, W. C. The Protein Information Resource. Nucleic Acids Research. 2003, 31 (1): 345–347. PMC 165487 . PMID 12520019. doi:10.1093/nar/gkg040.
[4]
Boeckmann, B.; Bairoch, A.; Apweiler, R.; Blatter, M. C.; Estreicher, A.; Gasteiger, E.; Martin, M. J.; Michoud, K.; O'Donovan, C.; Phan, I.; Pilbout, S.; Schneider, M. The SWISS-PROT protein knowledgebase and its supplement TrEMBL in 2003. Nucleic Acids Research. 2003, 31 (1): 365–370. PMC 165542 . PMID 12520024. doi:10.1093/nar/gkg095.

[1] [1]
2002 Release: NHGRI Funds Global Protein Database. National Human Genome Research Institute (NHGRI). [14 April 2018]. （原始内容存档于2015-09-24）.

[pmid12230036-2] [2]
O'Donovan, C.; Martin, M. J.; Gattiker, A.; Gasteiger, E.; Bairoch, A.; Apweiler, R. High-quality protein knowledge resource: SWISS-PROT and TrEMBL. Briefings in Bioinformatics. 2002, 3 (3): 275–284. PMID 12230036. doi:10.1093/bib/3.3.275.

[pmid12520019-3] [3]
Wu, C. H.; Yeh, L. S.; Huang, H.; Arminski, L.; Castro-Alvear, J.; Chen, Y.; Hu, Z.; Kourtesis, P.; Ledley, R. S.; Suzek, B. E.; Vinayaka, C. R.; Zhang, J.; Barker, W. C. The Protein Information Resource. Nucleic Acids Research. 2003, 31 (1): 345–347. PMC 165487 . PMID 12520019. doi:10.1093/nar/gkg040.

[pmid12520024-4] [4]
Boeckmann, B.; Bairoch, A.; Apweiler, R.; Blatter, M. C.; Estreicher, A.; Gasteiger, E.; Martin, M. J.; Michoud, K.; O'Donovan, C.; Phan, I.; Pilbout, S.; Schneider, M. The SWISS-PROT protein knowledgebase and its supplement TrEMBL in 2003. Nucleic Acids Research. 2003, 31 (1): 365–370. PMC 165542 . PMID 12520024. doi:10.1093/nar/gkg095.

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UniProt共同体

UniProt数据库的根源

参考文献

外部链接