化学中,CPK配色是一种国际通用的原子分子模型的配色方式,也是最常用、最多人使用的分子模型上色方式,可用于各种分子模型元素标示,最常用于球棒模型空间填充模型。该配色方式由CPK模型的设计者Corey、Pauling(莱纳斯·鲍林)与Koltun提出且改进。

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一个塑料制的脯氨酸MolyMod球棒模型。 这些模型通常遵守CPK配色。
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一个依照CPK配色上色的元素周期表

历史

1952年,科里和鲍林发表了描述蛋白质和其他生物分子空间填充模型,他们已经在加州理工学院制做出一个模型[1]。他们用硬球表示原子并涂上一些代表性的鲜艳颜色,来表示相应的化学元素。他们的上色模式为:

More information 元素, 用色 ...
元素与色彩
元素 用色
红色
黑色 单质碳为黑色
天蓝色
白色
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他们还建立塑料球小模型使用搭配同色系的架构。

1965年,Koltun将Corey和鲍林建模技术的改进版本申请专利获准[2]。在他的专利中,他提到了以下颜色:

More information 元素, 用色 ...
元素与色彩
元素 用色
白色
黑色
蓝色
红色
深黄色
紫色
卤素 绿色
金属
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现在常用的CPK配色将色彩更变为:

More information 元素, 用色 ...
元素与色彩
元素 用色
白色
黑色 单质的颜色
深蓝色
红色
黄色 单质的颜色
橙色
卤素 淡绿色 来自单质的颜色
金属 依照离子特性上色,其余洋红色
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典型的配色

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一箱球棒模型零件,相同颜色代表同一种元素

典型的CPK配色包括:

  (H) 白色
  (C) 黑色
  (N) 深蓝色
  (O) 红色
  (F)、 (Cl) 草绿
  (Br) 红棕色
  (I) 深紫罗兰色
  稀有气体HeNeArKrXe 水蓝色
  (P) 橘色
  (S) 黄色
  (B)、大多数过渡金属 桃色、 鲑鱼的颜色
  碱金属LiNaKRbCsFr 紫色
  碱土金属BeMgCaSrBaRa 深绿色
  (Ti) 灰色
  (Fe) 铁锈色
  其他元素 洋红色

有些CPK颜色是来自于纯元素的颜色或该元素的常见化合物的颜色,以便于记忆。例如,是一种无色气体木炭石墨皆是黑色;常见的黄色的;氯气是一种绿色气体溶于乙醚是一个暗红色液体罗兰色的;无定形磷红色铁锈暗橙色红色等。对于一些的颜色,如氧气氮气,则来源不可考。也许是因为氧气燃烧或含氧血液血红蛋白红色所以将氧定义成红色;地球大气层的主要组成部分,从而出现到人看到的天空天蓝色因此将氮设定成蓝色。[来源请求]

化学键的颜色

一般化学键的颜色会依据邻近元素上色,若两端元素相同,则将键漆上邻近原子的颜色,若两端原子不同,则依照电子云可能的分布来决定两端元素在键上上色的比例。有些模型则将键统一涂上同一种颜色,常见的颜色为灰色或白色。离子键一般不会描绘,另外氢键也有人使用黄色的虚线表示[3]

其他的CPK配色方式

下表显示了一些流行的软件分配给每个元素的颜色。C列是原始由Corey和鲍林设定的CPK配色[1],K是Koltun的专利[2],J列是由分子可视化的Jmol使用的配色方案[4],R列是Rasmol使用的配色方案,其显示两种颜色,第二种表是2.7.3及以后版本所使用的颜色[4][5]。所有的颜色都很相似的,并且可能依赖于显示硬件和观看条件。

More information 原子序, 符号 ...
原子序 符号 元素 颜色
C K J R
1 H        
1 2H (D)  
1 3H (T)  
2 He    
3 Li     
4 Be    
5 B    
6 C         
6 13C 碳-13  
6 14C 碳-14  
7 N         
7 15N 氮-15  
8 O         
9 F      
10 Ne    
11 Na    
12 Mg    
13 Al     
14 Si    
15 P       
16 S       
17 Cl      
18 Ar    
19 K    
20 Ca     
21 Sc    
22 Ti     
23 V    
24 Cr     
25 Mn     
26 Fe       
27 Co      
28 Ni       
29 Cu       
30 Zn     
31 Ga    
32 Ge    
33 As    
34 Se    
35 Br       
36 Kr    
37 Rb    
38 Sr    
39 Y    
40 Zr    
41 Nb    
42 Mo    
43 Tc    
44 Ru    
45 Rh    
46 Pd    
47 Ag     
48 Cd    
49 In    
50 Sn    
51 Sb    
52 Te    
53 I      
54 Xe    
55 Cs    
56 Ba     
57 La    
58 Ce    
59 Pr    
60 Nd    
61 Pm    
62 Sm    
63 Eu    
64 Gd    
65 Tb    
66 Dy    
67 Ho    
68 Er    
69 Tm    
70 Yb    
71 Lu    
72 Hf    
73 Ta    
74 W    
75 Re    
76 Os    
77 Ir    
78 Pt    
79 Au    
80 Hg    
81 Tl    
82 Pb    
83 Bi    
84 Po    
85 At    
86 Rn    
87 Fr    
88 Ra    
89 Ac    
90 Th    
91 Pa    
92 U    
93 Np    
94 Pu    
95 Am    
96 Cm    
97 Bk    
98 Cf    
99 Es    
100 Fm    
101 Md    
102 No    
103 Lr    
104 Rf 𬬻    
105 Db 𬭊    
106 Sg 𬭳    
107 Bh 𬭛    
108 Hs 𬭶    
109 Mt    
110 Ds 𫟼    
111 Rg 𬬭    
112 Cn    
113 Nh    
114 Fl 𫓧    
115 Mc    
116 Lv 𫟷    
117 Ts    
118 Og    
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参见

参考文献

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