核碱基（英语：nucleobase）又称含氮碱基（nitrogenous base）[1][2]，生物学常简称碱基（base），是一类性质为碱性且拥有氮的化合物，也是在DNA和RNA中起配对作用的部分。例如嘧啶类是核碱基，胺类是最典型的含氮碱基；核碱基与含氮碱基两者称呼只是强调重点不同而已，前者以生物学的角度强调此碱在核苷酸中[3]，后者以化学的角度强调此有机碱含有氮原子。
核碱基都是杂环化合物，其氮原子位于环上或取代氨基上，其中一部分（取代氨基，以及嘌呤环的1位氮、嘧啶环的3位氮）直接参与碱基配对。
常见的核碱基共有5种：胞嘧啶（缩写C）、鸟嘌呤（G）、腺嘌呤（A）、胸腺嘧啶（T，通常为DNA专有）和尿嘧啶（U，通常为RNA专有）。腺嘌呤和鸟嘌呤属于嘌呤族（缩写作R），它们具有双环结构。胞嘧啶、尿嘧啶、胸腺嘧啶属于嘧啶族（Y），它们的环系是一个六元杂环。RNA中，尿嘧啶取代了胸腺嘧啶的位置。胸腺嘧啶比尿嘧啶多一个5位甲基，这个甲基增大了遗传的准确性。
| 鸟嘌呤（G） | 腺嘌呤（A） | |
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| 胞嘧啶（C） | 胸腺嘧啶（T） | 尿嘧啶（U） |
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核碱基的形式
主要核碱基与核苷的结构
核碱基通过糖苷键与核糖或脱氧核糖的1位碳原子相连而形成的化合物叫核苷。核苷再与磷酸结合就形成核苷酸，磷酸基接在五碳糖的5位碳原子上。
| 核碱基 |
腺嘌呤 |
鸟嘌呤 |
胸腺嘧啶 |
胞嘧啶 |
尿嘧啶 |
| 核苷 |
 腺苷 A |
 鸟苷 G |
 胸苷 T |
 胞苷 C |
 尿苷 U |
DNA与RNA含不同核碱基
核碱基的配对
核碱基位于DNA二股上，而重要的是二股上的碱基会互相连结：腺嘌呤与胸腺嘧啶配对、鸟嘌呤与胞嘧啶的配对，这样两两通过氢键的配对称为“碱基对”，[5]如图：
 |
 |
腺嘌呤与胸腺嘧啶之间的配对只有两根氢键，而鸟嘌呤与胞嘧啶之间的配对有三根，因此含有G-C碱基对较多的DNA较为稳定。
简拼核碱基符号
| 符号 | 代替碱基 |
|---|---|
| R | A/G |
| Y | C/T |
| M | A/C |
| K | G/T |
| S | G/C |
| W | A/T |
| H | A/T/C |
| B | G/T/C |
| V | G/A/C |
| D | G/A/T |
| N | A/G/C/T |
中间产物
| 核碱基 |
 次黄嘌呤 |
 黄嘌呤 |
 7-甲基鸟嘌呤 |
 5,6-二氢尿嘧啶 |
| 核苷 |
 次黄苷 I |
 黄苷 X |
 7-甲基鸟苷 m7G |
 二氢尿苷 D |
新四大核碱基
近几年有人将表观遗传学修饰的5-甲基胞嘧啶（5mC）称为第5种碱基，5-羟甲基胞嘧啶（5hmC）称为第6种碱基。2011年研究人员发现了第7种DNA碱基“5-甲酰基胞嘧啶”（5fC），和第8种“5-羧基胞嘧啶”（5caC）。这几种碱基实际上都是由胞嘧啶经由Tet蛋白修饰后形成。人类和小鼠干细胞都拥有Tet蛋白，Tet蛋白是重新编程已经分化的细胞的一种重要功能蛋白[6]。
参看
外部链接
参考文献
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