У 1872 році Голуб відправився на алмазні поля в Кімберлі і на власні кошти від хірургічної практики, спорядив експедицію у північний Трансвааль, Машоналенд і через Бечуаналенд до водоспаду Вікторія. Еміль Голуб зібрав багату колекцію, яку в 1879 році привіз до Європи і передав сотням музеїв та навчальних закладів.
У 1883 році Голуб повернувся до Південної Африки разом з дружиною, бажаючи перетнути весь африканськийконтинент від Кейптауна до Єгипту. У червні 1886 року його експедиція перетнула річку Замбезі на захід від водоспаду Вікторія і досліджувала раніше невідомий регіон між Замбезі і Кафуе.
Однак на північ від Кафуе на мандрівників напали тубільці і вони вимушені були повернутися назад.
У 1887 році Е. Голуб повернувся в Австрію з новою колекцією з понад 13 тисяч предметів, які розійшлася по музеях Європи. Голуб видав щоденники своїх подорожей: «Сім років в Південній Африці» (1881) і «Подорожі, 1883—1887» (1890).
Дружина Еміля Голуба — Роза Хофова — народилася 11 травня 1865 року. Вона познайомилася з Емілем Голубом після його повернення з його першої подорожі до Африки, коли він зберігав предмети колекції у Відні. Вона була його співробітником протягом чотирьох років і супроводжувала його у другій поїздці до Африки. Роза жила з Емілем Голубом у Відні до його смерті.
Основна колекція зберігається в Африканському музеї в Голіце, відкритому в 1970 році.
Особисті документи, щоденники, зошити, дипломи, малюнки, фотографії, вирізки зберігаються в музеї Напстека у Празі
У 1993 році чеський паб-рок-гурт Three Sisters присвятив пісню Lidojedi Емілю Голубу
31 січня 1999 року гімназії в Холіце було присвоєно почесне звання Еміля Голуба.
20 лютого 2002 року Чеський національний банк випустив срібну монету номіналом 200 крон, щоб відзначити 100 років з дня смерті доктора Еміля Голуба.
У 2002–2006 роках Посольство Чеської Республіки організувало ряд заходів, пов'язаних з промоцією Еміля Голуба.
У 2005 році під час опитування глядачів Чеського телебачення йому віддали 90-е місце серед видатних особистостей Чехії.
Encyclopædia Britannica Eleventh Edition.— New York: Encyclopædia Britannica, Inc, 1911.— Т.13.
BAUM, Jiří. Holub a Mašukulumbové: kapitoly o největším českém cestovateli. Praha: Nakladatelství Československé akademie věd, 1955. 127 s. Dostupné online.
BAUŠE, Bohumil. Život a cesty doktora Emila Holuba. Praha: J. Otto, 1907. 195 s.
BĚHOUNEK, František. Na sever od Zambezi: Cesty doktora Emila Holuba. Praha: Toužimský & Moravec, 1946. 212 s.
DLOUHÝ, Jindřich. Dr. Emil Holub: africký cestovatel. Praha: Náprstkovo muzeum v Praze, 1947. 173 s.
FORST, Vladimír, a kol. Lexikon české literatury: osobnosti, díla, instituce. 2/I. H–J. Praha: Academia, 1993. 589 s. ISBN 80-200-0468-8.
HOLUB, Emil. Sedm let v jižní Africe: příhody, výzkumy a lovy na cestách mých od polí diamantových až k řece Zambesi (1872-1879). Praha: J. Otto, 1880. Dostupné online.
HOLUB, Emil. Druhá cesta po Jižní Africe: Z kapského města do země Mašukulumbův: Cesty v Jižní Africe vykonané v letech 1883-1887. Praha: J. Otto, 1890. Dostupné online.
KAFKA, Josef. Průvodce africkou výstavou cestovatele Dra. Emila Holuba. Praha: J. Otto, 1892. 79 s. Dostupné online.
LEV, Vojtěch, PODHAJSKÝ Jan. Za velkým dobrodružstvím: vypravování o českém cestovateli. Praha: Komenium, 1947. 227 s.
MARTÍNEK, Jiří; MARTÍNEK, Miloslav. Kdo byl kdo: světoví cestovatelé a mořeplavci. Praha: Libri, 2003. 551 s. ISBN 80-7277-118-3. S. 253–255.
STREIT, Vincenc. S jménem Rosa Afrikou (Žena rovná mužům). Pelhřimov: [s.n.], 2010. 144 s. ISBN 978-80-7415-042-5.
ŠÁMAL, Martin. Emil Holub: Cestovatel – etnograf - spisovatel. Praha: Nakladatelství Vyšehrad, 2013. 304 s. ISBN 978-80-7429-243-9.
VALENTA, Edvard. Druhé housle: román o velké cestě Emila Holuba. Praha: ELK, 1945. 315 s.
VOTRUBEC, Ctibor. Jihoafrické cesty Emila Holuba. Praha: Mladá fronta, 1954. 157 s.
ŽELÍZKO, Jan Vratislav. Život a utrpení afrického cestovatele dra E. Holuba v posledních dopisech: (1897–1902). Praha: Vydavatelství Nové epochy, 1922. 93 s.