Біофізичні методи — набір методів, які використовуються для дослідження фізичних властивостей біологічних систем.
- Оптична мікроскопія
- Електронна мікроскопія — метод, що використовується для отримання зображень високої якості.
- Лазерна конфокальна мікроскопія — метод, що використовується для отримання зображень та відео флуорисцентних молекул.
- Силова мікроскопія — метод, що дозволяє отримувати зображення окремих атомів.
- Денситометрія електронної хмарки — метод, що дозволяє отримувати зображення окремих молекул, атомів та хімічних зв'язків.
- Спектрофотометрія — вимірювання проходження світла через різні розчини чи речовини за різної довжини хвилі. Один з видів методу — колориметрія.
- Інфрачервона спектроскопія
- Оптична спектроскопія
- Ультрафіолетова спектроскопія
- Спектроскопія одиничних молекул — клас методів, які достатньо чутливі щоб відстежувати поодинокі молекули, часто включають флуоресцентну детекцію.
- Мас-спектрометрія — метод визначення молекулярної маси, хімічного складу, фазового складу та молекулярної структури речовин.
- ЯМР-спектроскопія — метод вивчення структури і динамічних властивостей молекул (див. наприклад ЯМР-спектроскопія білків).
- Електронний парамагнітний резонанс — використовується для визначення концентрацій певних молекул.
- Флуоресцентна спектроскопія — метод, що використовується для знаходження структурних перебудов молекул та взаємодій між ними.
- Силова спектроскопія — використовується для визначення механічних властивостей окремих молекул або макромолекулярних ансамблів з допомогою кантиліверу, фокусованого лазерного проміння, або магнітних полів.