ZEB1 (англ. Zinc finger E-box binding homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 124 амінокислот, а молекулярна маса — 124 074[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MADGPRCKRR | | KQANPRRNNV | | TNYNTVVETN | | SDSDDEDKLH | | IVEEESVTDA |
ADCEGVPEDD | | LPTDQTVLPG | | RSSEREGNAK | | NCWEDDRKEG | | QEILGPEAQA |
DEAGCTVKDD | | ECESDAENEQ | | NHDPNVEEFL | | QQQDTAVIFP | | EAPEEDQRQG |
TPEASGHDEN | | GTPDAFSQLL | | TCPYCDRGYK | | RFTSLKEHIK | | YRHEKNEDNF |
SCSLCSYTFA | | YRTQLERHMT | | SHKSGRDQRH | | VTQSGCNRKF | | KCTECGKAFK |
YKHHLKEHLR | | IHSGEKPYEC | | PNCKKRFSHS | | GSYSSHISSK | | KCISLIPVNG |
RPRTGLKTSQ | | CSSPSLSASP | | GSPTRPQIRQ | | KIENKPLQEQ | | LSVNQIKTEP |
VDYEFKPIVV | | ASGINCSTPL | | QNGVFTGGGP | | LQATSSPQGM | | VQAVVLPTVG |
LVSPISINLS | | DIQNVLKVAV | | DGNVIRQVLE | | NNQANLASKE | | QETINASPIQ |
QGGHSVISAI | | SLPLVDQDGT | | TKIIINYSLE | | QPSQLQVVPQ | | NLKKENPVAT |
NSCKSEKLPE | | DLTVKSEKDK | | SFEGGVNDST | | CLLCDDCPGD | | INALPELKHY |
DLKQPTQPPP | | LPAAEAEKPE | | SSVSSATGDG | | NLSPSQPPLK | | NLLSLLKAYY |
ALNAQPSAEE | | LSKIADSVNL | | PLDVVKKWFE | | KMQAGQISVQ | | SSEPSSPEPG |
KVNIPAKNND | | QPQSANANEP | | QDSTVNLQSP | | LKMTNSPVLP | | VGSTTNGSRS |
STPSPSPLNL | | SSSRNTQGYL | | YTAEGAQEEP | | QVEPLDLSLP | | KQQGELLERS |
TITSVYQNSV | | YSVQEEPLNL | | SCAKKEPQKD | | SCVTDSEPVV | | NVIPPSANPI |
NIAIPTVTAQ | | LPTIVAIADQ | | NSVPCLRALA | | ANKQTILIPQ | | VAYTYSTTVS |
PAVQEPPLKV | | IQPNGNQDER | | QDTSSEGVSN | | VEDQNDSDST | | PPKKKMRKTE |
NGMYACDLCD | | KIFQKSSSLL | | RHKYEHTGKR | | PHECGICKKA | | FKHKHHLIEH |
MRLHSGEKPY | | QCDKCGKRFS | | HSGSYSQHMN | | HRYSYCKREA | | EERDSTEQEE |
AGPEILSNEH | | VGARASPSQG | | DSDERESLTR | | EEDEDSEKEE | | EEEDKEMEEL |
QEEKECEKPQ | | GDEEEEEEEE | | EVEEEEVEEA | | ENEGEEAKTE | | GLMKDDRAES |
QASSLGQKVG | | ESSEQVSEEK | | TNEA |
Коротка інформація Наявні структури, PDB ...
ZEB1
|
---|
|
|
Ідентифікатори |
Символи |
ZEB1, zinc finger E-box binding homeobox 1, AREB6, BZP, DELTAEF1, FECD6, NIL2A, PPCD3, TCF8, ZFHEP, ZFHX1A |
Зовнішні ІД |
OMIM: 189909 MGI: 1344313 HomoloGene: 31779 GeneCards: ZEB1
|
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
Fuchs' endothelial dystrophy[1] |
Онтологія гена |
Молекулярна функція |
• DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • zinc ion binding • transcription factor binding • chromatin binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • E-box binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
Клітинна компонента |
• transcription regulator complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма
|
Біологічний процес |
• pattern specification process • embryonic skeletal system morphogenesis • regulation of smooth muscle cell differentiation • animal organ development • диференціація клітин • semicircular canal morphogenesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • regulation of T cell differentiation in thymus • central nervous system development • cartilage development • regulation of mesenchymal cell proliferation • embryonic camera-type eye morphogenesis • cochlea morphogenesis • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • embryonic morphogenesis • cellular response to amino acid stimulus • проліферація • negative regulation of epithelial cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell population proliferation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of neuron differentiation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of endothelial cell differentiation • cytokine-mediated signaling pathway
|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
|
Більше даних
|
Ортологи |
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
Ensembl |
|
|
UniProt |
|
|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 10: 31.32 – 31.53 Mb |
Хр. 18: 5.59 – 5.78 Mb |
PubMed search |
[2] |
[3]
|
---|
Вікідані |
|
Закрити
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Long J., Zuo D., Park M. (2005). Pc2-mediated sumoylation of Smad-interacting protein 1 attenuates transcriptional repression of E-cadherin. J. Biol. Chem. 280: 35477—35489. PMID 16061479 DOI:10.1074/jbc.M504477200
- Papadopoulou V., Postigo A., Sanchez-Tillo E., Porter A.C., Wagner S.D. (2010). ZEB1 and CtBP form a repressive complex at a distal promoter element of the BCL6 locus. Biochem. J. 427: 541—550. PMID 20175752 DOI:10.1042/BJ20091578
- Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
- Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
- Chung D.W., Frausto R.F., Ann L.B., Jang M.S., Aldave A.J. (2014). Functional impact of ZEB1 mutations associated with posterior polymorphous and Fuchs' endothelial corneal dystrophies. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 55: 6159—6166. PMID 25190660 DOI:10.1167/iovs.14-15247