SOX3 (англ. SRY-box 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 446 амінокислот, а молекулярна маса — 45 210[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MRPVRENSSG | | ARSPRVPADL | | ARSILISLPF | | PPDSLAHRPP | | SSAPTESQGL |
FTVAAPAPGA | | PSPPATLAHL | | LPAPAMYSLL | | ETELKNPVGT | | PTQAAGTGGP |
AAPGGAGKSS | | ANAAGGANSG | | GGSSGGASGG | | GGGTDQDRVK | | RPMNAFMVWS |
RGQRRKMALE | | NPKMHNSEIS | | KRLGADWKLL | | TDAEKRPFID | | EAKRLRAVHM |
KEYPDYKYRP | | RRKTKTLLKK | | DKYSLPSGLL | | PPGAAAAAAA | | AAAAAAAASS |
PVGVGQRLDT | | YTHVNGWANG | | AYSLVQEQLG | | YAQPPSMSSP | | PPPPALPPMH |
RYDMAGLQYS | | PMMPPGAQSY | | MNVAAAAAAA | | SGYGGMAPSA | | TAAAAAAYGQ |
QPATAAAAAA | | AAAAMSLGPM | | GSVVKSEPSS | | PPPAIASHSQ | | RACLGDLRDM |
ISMYLPPGGD | | AADAASPLPG | | GRLHGVHQHY | | QGAGTAVNGT | | VPLTHI |
Коротка інформація Ідентифікатори, Символи ...
SOX3
|
---|
|
Ідентифікатори |
Символи |
SOX3, GHDX, MRGH, PHP, PHPX, SOXB, SRY-box 3, SRY-box transcription factor 3 |
Зовнішні ІД |
OMIM: 313430 MGI: 98365 HomoloGene: 4118 GeneCards: SOX3
|
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
isolated growth hormone deficiency[1] |
Онтологія гена |
Молекулярна функція |
• DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
Клітинна компонента |
• клітинне ядро • нуклеоплазма
|
Біологічний процес |
• multicellular organism development • sensory organ development • central nervous system development • face development • pituitary gland development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of neuron differentiation • transcription, DNA-templated • hypothalamus development • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • Детермінація статі • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • диференціація клітин • neuron differentiation
|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
|
Більше даних
|
Ортологи |
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
Ensembl |
|
|
UniProt |
|
|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. X: 140.5 – 140.51 Mb |
Хр. X: 59.93 – 59.94 Mb |
PubMed search |
[2] |
[3]
|
---|
Вікідані |
|
Закрити
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
- Stevanovic M., Lovell-Badge R., Collignon J., Goodfellow P.N. (1993). SOX3 is an X-linked gene related to SRY. Hum. Mol. Genet. 2: 2013—2018. PMID 8111369 DOI:10.1093/hmg/2.12.2013
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504