Çağatay hanları listesi, bu maddede Cengiz Han'ın oğullarından Çağatay Han'ın ulusuna bağlı Çağatay Hanlığı, Doğu Çağatay Hanlığı ve Yarkand Hanlığı'nın hanlar listesi ve soy ağaçları mevcuttur.
- Çağatay, 1225-1242
- Kara Hülagû, 1242-1247, 1252 w:en:Qara Hülëgü
- Yesü Möngke, 1247-1252 w:en:Yesü Möngke
- Orgina Hatun, Kara Hülagû'nün karısı 1252-1261[1]
- Algu, 1261-1266
- Mübarek Şah, 1266, 1266 w:en:Mubarak Shah
- Gıyasettin Barak, 1266-1271 w:en:Baraq (Chagatai Khan)
- Negübeg, 1271-1272 w:en:Negübei
- Buga Temür, 1272-1291 w:en: w:en:Buqa Temür
- Yesü Duva, 1291-1306 w:en:Duwa
- Könçek, 1306-1308 w:en:Könchek
- Taligu, 1308-1309 w:en:Taliqu
- Kebek, 1309, 1318-1326
- I. Esen Buga, 1309-1318 w:en:Esen Buqa I
- Elcidigi, 1326 w:en:Eljigidey
- Duva Temür, 1326 w:en:Duwa Temür
- Alaaddin Tarmaşirin, 1326-1334
- Çangşi, 1334
- Buzan, 1334-1338 w:en:Buzan
- Yesün Temür, 1338-1342
- Muhammed, 1342-1343
- Kazan, 1343-1346
- Togluk Temür, Doğu Hanlığı 1347-1359, Çağatay Hanlığı 1359-1362
- İlyas Hoca, Çağatay Hanlığı 1362-1370, Doğu Hanlığı 1370-1383
- Kazan Казаган Batı Çağatay Emirliği 1346-1358
- Danişmend Şah, Çağatay Hanlığı 1346 w:en:Danishmendji
- Bayan Kuli, Batı Çağatay Hanlığı 1348-1359 w:en:Bayan Qulï
- Temürşah, Batı Çağatay Hanlığı 1359 w:en:Shah Temur
- Togluk Temür, Doğu Çağatay Hanlığı 1347-1359, Çağatay Hanlığı 1359-1362 w:en:Tughlugh Timur
- İlyas Hoca, Çağatay Hanlığı 1362-1370, Doğu Hanlığı 1370-1383 w:en:Ilyas Khoja
- Hüseyin, Batı Çağatay Emirliği 1364-1370
- Adil, Batı Çağatay Hanlığı 1370 w:en:Adil-Sultan
- Kabul Şah, 1359 w:en:Khabul Shah
- Surkatmış, Batı Çağatay Hanlığı 1370-1388 w:en:Suurgatmish
- Sultan Mahmud, Batı Hanlığı 1388-1398 w:en:Sultan Mahmud (Chagatai)
- Satuk, Batı Çağatay Hanlığı 1398-1405, ö. 1409
- Tugluk Temür, Doğu Çağatay Hanlığı 1347-1359, Çağatay Hanlığı 1359-1362
- İlyas Hoca, Çağatay Hanlığı 1362-1370, Doğu Çağatay Hanlığı 1370-1383
- Hıdır Hoca, Doğu Çağatay Hanlığı 1383-1399
- Şem-i Cahan, Doğu Çağatay Hanlığı 1399-1408
- Muhammed, Doğu Çağatay Hanlığı 1408-1416
- Şir Muhammed, Doğu Çağatay Hanlığı 1416
- Nakş-ı Cahan, Doğu Çağatay Hanlığı 1416-1418
- Sultan Üveys, Doğu Çağatay Hanlığı 1418-1429
- II. Esen Buga (Yesü), Doğu Çağatay Hanlığı 1446-1461 w:en:Esen Buqa II
- Dost Muhammed, Doğu Çağatay Hanlığı 1461-1466 w:en:Dost Muhammad (Moghul Khan)
- Yunus Han, d.1415, Doğu çağatay Hanlığı 1466-1486 w:en:Yunus Khan
- Kebek Han, Çalış[2]'ta Hanlığı 1466-1472 w:en:Kebek Sultan
- Sultan Mahmud Han, d.1443, Taşkent'te Hanlığı 1485-1501 w:en:Mahmud Khan (Moghul Khan)
- Sultan Ahmed Han, Doğu Çağatay Hanlığı 1486-1504 w:en:Ahmad Alaq
Yunus Han’ın küçük oğlu. Kalmuklara karşı yaptığı savaştan sonra, katil anlamına gelen alaça veya alaç lakabı verilmiştir.[3]
- Mansur, Aksu Hanlığı 1504-1514, Doğu Çağatay Hanlığı 1514-1544 w:en:Mansur Khan (Moghul Khan)
- Sultan Said Han, d.1487, Yarkand Hanlığı 1514-1533
- Ayman Hoca, Aksu'da Hanlığı 1516-1531
- Baba, Kuça'da Hanlığı 1516-
- Abdürreşid, d.1509, Yarkand Hanlığı 1533-1544, Doğu Çağatay Hanlığı 1544-1565
- Şah, Çalış'ta Hanlığı 1544-1570
- Abdül Kerim, Doğu Çağatay Hanlığı 1565-1592
- Abdül Muhammed, Çalış'ta Hanlığı 1570-
- Muhammed, Doğu Çağatay Hanlığı 1592-1610
- Hüdabende, Çalış'ta Hanlığı -1596
- Şah Şücayüdddin Ahmed, d.1570, Kaşgar Hanlığı 1596-1610, Doğu Çağatay Hanlığı 1610-1619
- Ziyayeddin Ahmed Timur, Aksu'da Hanlığı 1596-1614
- Abdürrahman, d.1560, Çalış'ta Hanlığı 1596-1624
- Abdüllatif Apak, Kaşgar Hanlığı 1611-1619, Doğu Çağatay Hanlığı 1619-1627
- Kureyş, Doğu Çağatay Hanlığı 1619
- Abdullah, Çalış'ta Hanlığı 1624-1637, Doğu Çağatay Hanlığı 1637-1667
- Sultan Ahmed Pulad, Doğu Çağatay Hanlığı 1627-1632 ve 1635-1637
- Sultan Mahmud Kılıç, Kaşgar Hanlığı 1627-1632, Doğu Çağatay Hanlığı 1632-1635
- Cülbars, Kaşgar Hanlığı 1637-1665, Hotan Hanlığı 1665-1667, Doğu Çağatay Hanlığı 1667-1669
- Ebu ül Muhammed, Çalış'ta Hanlığı 1637-1655
- İbrahim, Hotan Hanlığı 1637-1641, Çalış'ta Hanlığı 1655-
- Sultan Said Baba, Hami Hanlığı 1637-
- Hayreddin, Hotan Hanlığı 1641-1650, Aksu Hanlığı 1650-1667
- Übeydullah, Hotan Hanlığı 1661-1665
- İsmail, Aksu Hanlığı 1667-1670, Doğu Çağatay Hanlığı 1670-1678
- Abdullatif, Doğu Çağatay Hanlığı 1669-1670
- Muhammed Emin, Doğu Çağatay Hanlığı 1681-1692
- Muhammed Mumin, Doğu Çağatay Hanlığı 1692-1706
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Cengiz | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | Çağatay | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Ögeday | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | Mötügen | | Möç Yaba | | Sarban | | Y.Mönke | | Baidar | | | | | | | | | | | | | | | | | | Kadan | | Melik | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | |
| | | | | Buri | | Yesü Duva | | K.Hülagû | | Tegdel | | Negübeg | | | | | | Algu | | | | | | | | | | | | | | | | | | - | | - | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | |
| Kadakçi | | - | | - | | Barak | | Mübarekşah | | | | | | | | | | Çubey | | | | | | | | | | | | | | | | | | Y.Temür | | - | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | |
| Taligu | | B.Temür | | | | | | Duva | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | - | | Danişmend | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | - | | Kutluk H | | Gönçek | | Y.Buga | | Kebek | | Ebgen | | Elcidige | | D.Temür | | Tarmaşirin | | Solgat | | Emir Hoca | | Ali Sultan | | Surkatmış | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | |
| | | | | Yasaur | | | | | | Pulad | | | | | | Çangşi | | Y.Tenür | | Dorj | | Buzan | | | | | | Buyan Kuli | | T.Temür | | | | | | S.Mahmud | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | Kazan | | | | | | Muhammed | | | | | | | | | | Temürşah | | Kabulşah | | | | | | | | | | | | | | Moğolistan | | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| Timur | | S.Mülk | | | | | | Adil | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Timur İmp. | |
|
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | | Emir Hoca | | | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | | Tugluk Timur | | | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | İlyas H | | Hıdır H | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | Şm.Cahan | | Muhammed | | Şir Ali | | Şh Cahan | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | Ş.Muhammed | | Satuk | | Üveys | | Nkş Cahan | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | Yunus | | Esen Buka | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | | Hub Nigâh | | Mahmud | | Ahmed | | Kutluk Nigâh | | D.Muhammed | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | |
| | Mansur | | Said | | Babaçak | | Emin Hoca | | Babür | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | Şah | | Abdürreşid | | | | | | Mesud | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | Abdülkerim | | Muhammed | | Kureyş | | Yunus | | Abdürrahim | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | |
| | | | | | Ahmed | | M.Hüdabende | | Kureyş | | Abdullah | | İsmail | | Said Baba | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | |
| | Timur | | Abak | | Yolbars | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | Pulad | | Kılıç | | Abdullatif | | Abdürreşid | | M.Emin | | Akbaş | | Hanım Pdş | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
Svat Soucek, A History of Inner Asia, sayfa 321
Materialı po İstorii Kazahskih Hanstv v XV-XVIII Vekov, (İzvileçeniya iz Persidskih i Turskih Soçineniy), Alma-ata, 1969, sayfa 115, 203, 208-212, 216, 329.