Ang Ilog Apayao ay isang ilog na matatagpuan sa Hilagang Luzon sa lalawigan ng Apayao, Pilipinas ito ay dumadaloy sa watershed ng kanlurang bahagi ng lalawigan at dumadaloy pababa sa bayan ng Kabugao ay patungo palabas sa Karagatang Pasipiko sa baybayin ng Abulog, Ang magkakadugsong na ilog ay tinagurian " Apayao-Abulug", ang ika 9th sa malalaking ilog sa Pilipinas.