Purtsi är en by i Elva kommun i landskapet Tartumaa i södra Estland. Byn ligger vid Riksväg 52 samt ån Purtsi jõgi som har sitt utflöde i den större ån Väike Emajõgi vid byns västra gräns. Väike Emajõgi mynnar i sin tur ut i sjön Võrtsjärv i nordväst.