Antitrombin

From Wikipedia, the free encyclopedia

Antitrombin

Antitrombin (AT) je mali proteinski molekul koji inaktivira nekoliko enzima koagulacionog sistem. Antitrombin je glikoprotein koji formira jetra i sastoji se od 432 aminokiselina. On sadrži tri disulfidne veze i četiri moguća mesta glikozilacije. α-Antitrombin je dominantna forma antitrombina nađena u krvnoj plazmi i sadrži oligosaharid u sva četiri mesta glikozilacije. Jedno mesto glikozilacije je konzistentno nezauzeto u drugoj formi antitrombina, β-antitrombinu.[1] Njegova aktivnost se višestruko povećava antikoagulantskim lekom heparinom, koji pojačava vezivanje antitrombina za faktor II i faktor X.

Укратко Inhibitor serpin peptidase inhibitor, C (antitrombin), član 1, Dostupne strukture ...
Inhibitor serpin peptidase inhibitor, C (antitrombin), član 1
Monomer antitrombina, prikaz baziran na 2ANT.
Dostupne strukture
1ANT, 1ATH, 1AZX, 1BR8, 1DZG, 1DZH, 1E03, 1E04, 1E05, 1JVQ, 1LK6, 1NQ9, 1OYH, 1R1L, 1SR5, 1T1F, 1TB6, 2ANT, 2B4X, 2B5T, 2BEH, 2GD4, 2HIJ, 2ZNH, 3EVJ, 3KCG
Identifikatori
Simboli SERPINC1; AT3; AT3D; ATIII; THPH7
Vanjski ID OMIM: 107300 MGI: 88095 HomoloGene: 20139 GeneCards: SERPINC1 Gene
Pregled RNK izražavanja
podaci
Ortolozi
Vrsta Čovek Miš
Entrez 462 11905
Ensembl ENSG00000117601 ENSMUSG00000026715
UniProt P01008 P32261
RefSeq (mRNA) NM_000488.3 NM_080844.4
RefSeq (protein) NP_000479.1 NP_543120.1
Lokacija (UCSC) Chr 1:
173.87 - 173.89 Mb
Chr 1:
162.91 - 162.93 Mb
PubMed pretraga
Затвори

Nomenklatura antitrombina

Antitrombin se takođe naziva antitrombin III (AT III). Oznake antithrombin I do antitrombina IV potiču i ranijih studija tokom 1950-tih.[2]

Antitrombin I (AT I) se odnosi na apsorpciju trombina u fibrin nakon aktivacije trombina fibrinogenom. Antitrombin II (AT II) se odnosi na kofaktor u plazmi, koji zajedno sa heparinom ometa interakciju trombina i fibrinogena. Antitrombin III (AT III) se odnosi na supstancu u plazmi koja inaktivira trombin. Antitrombin IV (AT IV) se odnosi na antitrombin koji postaje aktiviran tokom i kratkotrajno nakon koagulacije krvi.[3] AT III a posebno AT I su medicinski značajni. AT III se generalno odnosi samo na "antitrombin".

Struktura

Thumb
Lokacije četiri potencijalna mesta glikozilacije unutar tercijarne strukture antitrombinskog monomera su prikazana (2ANT). U ovoj strukturi je jedino 155 glikoziliran dodatkom jednog ostatka -acetilglukozamina.

Antitrombin ima poluživot u krvnoj plazmi od oko jednog dana.[4] Normalna antitrombinska koncentracija u ljudskoj krvnoj plazmi je visoka, oko 0.12 , što je ekvivalentno sa molarnom koncentracijom od 2.3 .[5]

Antitrombin je izolovan iz plazme velikog broja vrsta.[6] Iz rezultata proteinskog i kDNK sekvenciranja, goveđeg, ovčijeg, zečijeg i mišjeg antitrombina sledi da su oni 433 aminokiseline dugi, što je za jednu aminokiselinu duže od ljudskog antitrombina. Dodatna aminokiselina se javlja u poziciji 6. Antitrombini govečeta, ovce, zeca, moša, i čoveka imaju 84 - 89% identične aminokiseline.[7] Šest aminokiselina formira tri intramolekularna disulfidna mosta, 8-, i . Svi oni imaju četiri potencijalna mesta -glikozilacije. Do nje dolazi na asparaginskim () aminokiselinama sa brojevima 96, 135, 155, i 192 kod ljudi i na sličnim pozicijama kod drugih vrsta. Sva ta mesta su zauzeta kovalentno vezanim oligosaharidnim bočnim lancima u predominantnoj formi ljudskog antitrombina, α-antitrombinu, tako da je molekulska težina ove forme antitrombina 58,200.[1] Potencijalno mesto glikozilacije asparagina 135 nije zauzeto u maje prisutnom obliku (oko 10%) antitrombina, β-antitrombinu.[8]

Rekombinantni antitrombini osobina sličnih normalnom ljudskom antitrombinu su bili proizvedeni koristeći insektne ćelije inficirane bakulovirusom i ćelije sisara gajene u ćelijskoj kulturi.[9][10][11][12] Ti rekombinantni antitrombini generalno imaju različite obrasce glikozilacije u odnosu na normalni antitrombin, i tipično se koriste u strukturnim studijama antitrombina. Mnoštvo antitrombinskih struktura je javno dostupno.

Reference

Literatura

Spoljašnje veze

Loading related searches...

Wikiwand - on

Seamless Wikipedia browsing. On steroids.