У току рата у БиХ се на страни тадашње Армије Републике Босне и Херцеговине, као владиних снага с бошњачко-муслиманском већином, борили и добровољци из бројних исламских земаља, попут Саудијске Арабије, Пакистана, Турске, Алжира, Авганистана, Египта, Ирана, Судана и Сирије. Већином се радило о верским борцима — муџахединима, по чему је јединица и добила назив.
Према књизи Пси рата на Балкану Драгана Џамића, центри за обуку и боравак муџахедина саграђени су у селу Арнаути, шест километара од Зенице према Какњу, у бившем омладинском селу Немила, у одмаралишту зеничке железаре Бистричак, у школи у Страњанима, Црквици и селу Касаповић. Све више су примећивани у Зеници, Тузли, Цазинској крајини, код села Горња Копривна и Злопољац, у околини Тешња и Брезе. Почетком септембра 1992. у Босну је стигло око 250 „светих ратника” из Турске, Ирана, Бахреина и Катара.
Многи од њих су били припадници терористичке групе Ел Мухаџирун, са око 200 Енглеза пакистанског порекла, војнички обучени у Пакистану од стране пакистанске терористичке групе Харкат ел Анзар.
Муџахедини су били распоређивани у најфанатичнијим одредима, који су се називали и Муслиманским одбрамбеним снагама (МОС), где су им поверавана места инструктора, заповедника и верских повереника. Кад нису ратовали, радили су на ширењу ислама међу локалним становништвом, стриктном поштовању његових правила и изворном тумачењу Курана. Део њих се и данас налази на простору Федерације Босне и Херцеговине и активно делују у склопу исламске заједнице и разних хуманитарних организација, како домаћих тако и страних, првенствено из арапских земаља.
Sejdžmen, Mark (2006). Terorističke mreže. Beograd: Udruženje diplomaca Centra Džordž K. Maršal: Altera. 134986508
Суботић, Милован (2015). Екстремизам под окриљем религије — Исламистички екстремизам на примерима БиХ и Србије. Београд: Медија центар „Одбрана”. 218048780
Šindler, Džon R. (2009). Nesveti teror: Bosna, Al Kaida i uspon globalnog džihada. Beograd: Službeni glasnik. 158123532
Galli, Aasta; Harris, Sophie; Hughes, Joshua; Lisma, Aino; Mohammed, Farheen; We, Julia (2013). „Bosnia’s Role in the Syrian Conflict”(PDF). Richardson institute.
International Crisis Group (2001). „Bin Laden and the Balkans:The Politics of Anti-terrorism”. ICG Balkans Report. 119.
Jacquard, Ronald (2002). In the Name of Osama Bin Laden: Global Terrorism and the Bin Laden Brotherhood. Collingdale, Pennsylvania: Diane Pub Co. ISBN9780756767112.
van Zuijdewijn, Jeanine de Roy; Bakker, Edwin (2014). „Returning Western foreign fighters: The case of Afghanistan, Bosnia and Somalia”. ICCT Background Note.
