Johannes Thiele (* 1. október 1860, Gołdap, Poľsko – † 5. august 1935) bol nemecký zoológ, ktorý sa špecializoval na mäkkýše.
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Jeho dielo Handbuch der systematischen Weichtierkunde (anglická verzia publikovaná pod názvom Handbook of Systematic Malacology) je štandardným dielom. Od roku 1904 až do dôchodku v roku 1925 bol kurátorom kolekcie mäkkýšov v Prírodovednom múzeu v Berlíne.
Thieleova klasifikácia ulitníkov sa v minulosti používala desaťročia. Modifikovala skorší koncept Henri Milne-Edwardsa (1848) s troma podtriedami: predožiabrovce, zadožiabrovce a pľúcnatce. Thieleova klasifikácia bola založená na celkovej podobnosti medzi druhmi. Táto klasifikácia bola však v priebehu rokov takisto pozmenená.
- Die Mundlappen der Lambellibranchiaten. Dissertation, Heidelberg 1886.
- Die Stammesverwandtschaft der Mollusken. Ein Beitrag zur Phylogenie der Tiere. In: Jenaische Zeitschrift für Naturwissenschaft 25, Jena 1891, S. 480–543.
- Wurmmollusken. In: Sitzungsberichte der naturwissenschaftlichen Gesellschaft ISIS. Dresden 1892, S. 3–4.
- Über die Zungen einiger Landdeckelschnecken. In: Nachrichtsblatt der Deutschen Malakozoologischen Gesellschaft 26, 1894, S. 23–25.
- Beiträge zur vergleichenden Anatomie der Amphineuren. I. Über einige Neapler Solenogastres. In: Zeitschrift für wissenschaftliche Zoologie 58, 1894, S. 222–302.
- Hemitrichia guimarasensis n. sp. In: Nachrichtsblatt der Deutschen Malakozoologischen Gesellschaft 27, 1895, S. 131–132.
- Über die Verwandtschaftsbeziehungen der Amphineuren. In: Biologisches Centralblatt 15, 1895, S. 859–869.
- Zwei australische Solenogastres. In: Zoologischer Anzeiger 19, 1897, S. 398–400.
- Verzeichnis der von Herrn Dr. A. Voeltzkow gesammelten marinen und litoralen Mollusken. In: Abhandlungen herausgegeben von der Senckenbergischen Naturforschenden Gesellschaft 26, 1900, S. 241–252.
- Proneomenia amboinensis n. sp. In: Denkschriften der Medizinisch-Naturwissenschaftlichen Gesellschaft zu Jena 8, 1902, S. 733–738.
- Zwei neue Macrodontes-Arten. In: Nachrichtsblatt der Deutschen Malakozoologischen Gesellschaft 38, 1906, S. 69–71.
- mit S. Jaeckel: Muscheln der Deutschen Tiefsee-Expedition. In: Wissenschaftliche Ergebnisse der Deutschen Tiefsee-Expedition auf dem Dampfer "Valdivia" 1898–1899 (Chun, C. ed.), vol. 21, No. 1, Gustav Fischer Verlag, Jena 1931.
- Molluskenfauna Westindiens. In: Zoologische Jahrbücher Abteilung für Systematik, Ökologie und Geographie der Tiere. Supplement 11, 1910, S. 109–132.
- Eine arabische Ennea und Bemerkungen über andere Arten. In: Sitzungsberichte der Gesellschaft naturforschender Freunde zu Berlin 6, Berlin 1910, S. 280–284.
- Mollusken der deutschen Zentralafrika-Expedition. In: Wissenschaftliche Ergebnisse der deutschen Zentralafrika-Expedition 1907 bis 1908. Vol. 3, 1911, S. 175–214.
- Die Fauna Südwest-Australiens. In: Ergebnisse der Hamburger südwest-australischen Forschungsreise 1905. Bd. III, Lieferung 11, Prof. Dr. W. Michaelsen und Dr. R. Hartmeyer, Gustav Fischer Verlag, Jena 1911.
- Familia Limidae. In: Systematisches Conchylien-Cabinet von Martini und Chemnitz. (Küster, H.C., Kobelt, W. & Haas, F. ed.), vol. 7, No. 2, Bauer & Raspe, Nürnberg 1920.
- Gastropoden der Deutschen Tiefsee-Expedition. In: Wissenschaftliche Ergebnisse der Deutschen Tiefsee-Expedition II Teil. Vol. 17, No. 2, Gustav Fischer Verlag, Berlin 1925.
- Über die Familie Assimineidae. In: Zoologische Jahrbücher Abteilung für Systematik, Ökologie und Geographie der Tiere 53, 1927, S. 113–146.
- Über einige brasilianische Landschnecken. In: Abhandlungen herausgegeben von der Senckenbergischen Naturforschenden Gesellschaft 40, 1927, S. 305–329.
- Revision des Systems der Hydrobiiden und Melaniiden. In: Zoologische Jahrbücher, Abteilung Systematik, Ökologie und Geographie der Tiere 55, 1928, S. 351–402.
- Mollusken vom Bismarck-Archipel, von Neu-Guinea und Nachbar-Inseln. In: Zoologische Jahrbücher Abteilung für Systematik, Ökologie und Geographie der Tiere 55, 1928, S. 119–146.
- Handbuch der systematischen Weichtierkunde. 2 Bände. (1929–1935), Gustav Fischer Verlag, Jena 1935.
- Thiele, J., 1929—1935. Handbuch der Systematischen Weichtierkunde. 2 zv., 1154 strán, 584 obrázkov
- Bieler, R. & P. M. Mikkelsen (eds.), 1992. Handbook of Systematic Malacology, Part 1 (Loricata [Polyplacophora]; Gastropoda: Prosobranchia). Smithsonian Institution and National Science Foundation, xviii + 625 pp., 470+1 text-fig. (Annotated English-language edition of: Thiele, J., Handbuch der systematischen Weichtierkunde, Teil 1). Tiež publikovaná v roku 1993 Gustavom Fischer Verlagom, Stuttgart/Jena/New York.